㈠ 细胞纯化分离—密度梯度篇
细胞纯化分离技术中，密度梯度法占据重要地位。单细胞测序因其能揭示混杂样品中隐藏的异质性信息而备受关注，这有助于研究细胞发育和调控机制。关键步骤是获得高纯度和完整细胞（核）悬液，这对于后续生信分析至关重要。密度梯度离心技术利用粒子在不同密度介质中的迁移速度进行分离，如蔗糖、Ficoll、Percoll和OptiPrep等。
蔗糖具有高渗透压，常用于细胞器、病毒和RNA分离，但不适于细胞分离；Ficoll适合分离特定密度的细胞，如从血液中分离淋巴细胞和单核细胞；Percoll的低粘度和稳定性使其适用于多种生物颗粒的纯化，如植物原生质体和叶绿体；OptiPrep则因其亲水性和高密度，广泛用于分离细胞、病毒和蛋白质等。
这些介质各有特点，例如Ficoll根据细胞密度的不同进行分离，而Percoll的颗粒大小异质性使其形成均匀梯度；OptiPrep的碘克沙醇浓度梯度能有效纯化不同类型的细胞。例如，Takamatsu等人优化了水稻叶绿体DNA提取，Gan等人使用Ficoll分离皮毛囊毛囊间充质干细胞，Bhattacharya等人则介绍了一种番茄叶绿体提取方法，而Kovacovicova等人则通过OptiPrep分离衰老细胞。每种方法都有其特定的应用范围和优化的实验步骤，以确保实验结果的高质量。