Ⅰ 反转录PCR的操作
1. 总RNA的提取。
2. cDNA第一链的合成(Reverse Transcription):如今试剂公司有多种cDNA第一链试剂盒出售,其原理基本相同,但操作步骤不一。现以GIBICOL公司提供的SuperScriptTM Preamplification System for First Strand cDNA Synthesis 试剂盒为例。
(1)在0.5ml微量离心管中,加入总RNA 1-5μg,补充适量的DEPC H2O使总体积达11μl。在管中加10μM Oligo(dT)12-18 1μl,轻轻混匀、离心。
(2)70℃加热10min,立即将微量离心管插入冰浴中至少1min。
然后加入下列试剂的混合物:
10×PCR buffer 2μl
25mM MgCl2 2μl
10mM dNTPmix 1μl
0.1M DTT 2μl
轻轻混匀,离心。42℃孵育2-5min。
(3)加入SuperscriptⅡ1μl ,在42℃水浴中孵育50min。
(4)于70℃加热15min以终止反应。
(5)将管插入冰中,加入RNase H 1μl ,37℃孵育20min,降解残留的RNA。-20℃保存备用。
3.PCR:
(1)取0.5ml PCR管,依次加入下列试剂:
第一链cDNA 2μl
上游引物(10pM) 2μl
下游引物(10pM) 2μl
dNTP(2mM) 4μl
10×PCR buffer 5μl
Taq 酶(2u/μl) 1μl
(2) 加入适量的ddH2O,使总体积达50μl。轻轻混匀,离心。
(3) 设定PCR程序。在适当的温度参数下扩增28-32个循环。为了保证实验结果的可靠与准确,可在PCR扩增目的基因时,加入一对内参(如G3PD)的特异性引物,同时扩增内参DNA,作为对照。
(4) 电泳鉴定:行琼脂糖凝胶电泳,紫外灯下观察结果。
(5) 密度扫描、结果分析:采用凝胶图像分析系统,对电泳条带进行密度扫描。
Ⅱ 怎么确定反转录完的CDNA中还有没有GDNA污染
对于新手来说购买反转录试剂盒是比较理想的,买一个kit看看说明书操作就可以了。推荐两款kit TAKARA和HaiGene,这两款试剂盒都能对RNA样品中的gDNA有效去除,因此对RNA质量的要求不高。TAKARA的RR047A操作方便,反转录温度为37℃,对于大多数试验来讲是满足要求的。HaiGene的D0401操作要多一个步骤,但其反转录温度是55℃(耐高温的反转录酶),提高了反转录温度使得高GC含量、复杂模板、长mRNA的模板都能有效反转录,因此其反转录效率更高,更能够获得样本中基因的真实表达量。如果后续试验是RealTime PCR、ORF克隆、高GC含量、或者你的待研究基因结构复杂程度未知,还是选用耐高温的反转录酶更理想。对于反转录高手来说,直接购买反转录酶、再购买Rnase Inhibitor自己配制反转录体系就可以了。对于样本量大的课题组来讲,相对还是比较经济的。选择反转录酶时仅需要考虑是否需要耐高温的酶,来克服目的基因的复杂结构就可以了。PROMEGA、TAKARA、HaiGene、 TRANSGEN等品牌的反转录酶性价比还都是不错的。Life、NEB的也不错,银子足的也可考虑,不一一解释了。
Ⅲ rt-pcr逆转录的温度一般设置为多少
1.变性RNA的过程还没有加入反转录酶,请仔细阅读说明书!
2.反转录酶有很多种,针对高GC的RNA反转,可以加入适量DTT,DMSO,甜菜碱等降低退火温度。当然也可以选用耐高温的反转录酶。
Ⅳ 反转录酶的注意事项
反转录酶
在进行RT反应之前,应考虑以下几个方面:
1、RNA
成功的cDNA合成来自高质量的RNA,高质量的RNA至少应保证全长并且不含逆转录酶的抑制剂,如EDTA或SDS。在提取RNA的过程中,要特别防止RNase的污染,同时在逆转录反应中经常加入RNase抑制剂以增加cDNA合成的长度和产量。RNase抑制剂要在第一链cDNA合成反应中,在缓冲液和还原剂(如DTT)存在的条件下加入,因为cDNA合成前的过程会使抑制剂变性,从而释放结合的可以降解RNA的RNase。蛋白RNase抑制剂仅防止RNaseA,B,C对RNA的降解,并不能防止皮肤上的RNase,因此尽管使用了这些抑制剂,也要小心不要从手指上引入RNase,实验过程中经常更换新手套。
2、引物的选择
OligodT
选择OligodT时,要求RNA必须有PolyA,所以真核生物的mRNA都适用。适合长链甚至全长mRNA的RT,所以对RNA样品的质量要求较高,最好不要有明显的DNA污染、RNA降解和RNA断裂。假如想探索新的mRNA进行RT反应,建议推荐使用OligodT引物。使用OligodT引物要比随机引物和特异性引物的稳定性要好。
随机引物
适合各种RNA的RT,尤其适合模板丰度很低的情况(比如某个gene表达量很低)。选择随机引物时,第一链cDNA合成反应中就是以所有的RNA为模板,然后进行PCR反应时设计引物进行特异性扩增。同时要注意随机引物的量和总RNA量之间的关系,一般建议每5μg总RNA的随机引物的用量为50ng,如果每5μg总RNA的随机引物的用量超过250ng,可能会导致小片段产物(<500bp)的增加和长片断、全长产物产物的降低。
特异性引物
特异性引物只能用你设计引物时的下游引物做RT,引物设计质量影响RT的结果,而且不同引物退火温度本来就不相同,所以按照说明书按照一个温度做不是最佳选择,一般不推荐。
Ⅳ mRNA反转录形成cDNA的步骤
mRNA反转录形成cDNA的步骤如下:
将mRNA置于PCR仪中,经过95度变性、72度延伸、Tm温度退火,来回30~35个循环,最后4度就能得到反转录的cDNA。
Ⅵ rna转cdna预变性温度是多少
博凌科为的THERMOscript 1st Strand cDNA Synthesis Kit(第一链耐热反转录试剂盒)反转录温度耐受性比较强,效果不错
本制品使用通过基因重组技术克隆表达的点突变型 RNase H 活性缺失的 M-MuLV 反转录酶
THERMOscript Hˉ RTase 。 同时经过多点突变,提高了反转录温度耐受性,可以在 45-55℃进行反转录。野生型的 M-MuLV 包含的 RNase H 活性能够催化降解 DNA\\/RNA 杂合体中的 RNA,因此 在 cDNA 第一 条链的 合成 反应中 可能 会降 解 RNA\\/DNA 杂合 体中的 模板 RNA 。 本酶
M-MuLV(RNase Hˉ)的 RNase H 活性缺失,与 M-MuLV 相比,具有更强的延伸能力和稳定性,
可用于较长的 cDNA 合成以及高比例的全长 cDNA 文库的构建等。同时更高的反转录温度大大的
提高了 GC 含量高,二级结构丰富的 RNA 模板的反转录效率。
注意事项::
1、 避免RNase污染。
2、为保证反转录成功建议使用高质量的RNA样品。
3、如果RNA模板GC含量丰富或者有复杂二级结构,可以先只加RNA模板、引物和和RNase free H2O混匀,65℃变性5分钟,冰上冷却,短暂离心后加入其它成分继续下面的反转录步骤。
Ⅶ 逆转录原理
逆转录PCR ( RT-PCR )的原理
逆转录PCR (RT-PCR )具有较高的灵敏性、操作简单等优点,常用于基因定量分析、生物学检测等,此外常用逆转录PCR克隆目的基因。 本文主要讲述了逆转录PCR的原理、重要参数以及操作注意事项。
cDNA的合成是RT-PCR 的重要环节。以mRNA为模板,在逆转录酶的催化下,随机引物、oligo(dT)或基因特异性引物的引导下合成互补的DNA(complementary DNA,cDNA),再按照普通PCR的方法用两条引物以cDNA为模板,则可扩增出不含内含子的可编码完整基因的序列。
逆转录PCR 重要参数
不同mRNA拷贝成cDNA的效率不同;因此,适合于一种mRNA拷贝的条件可能对另一种mRNA不适合。一般来说,从事不均一mRMA群体时,所使用的条件是导致cDNA合成的终产量达到最大,下述参数十分重要。
1.逆转录酶 有两种不同的逆转录酶可以催化以mRNA为模板,oligo(dT)作为引物,合成与mRNA互补的cDNA链。一种来自纯化的禽成髓细胞瘤病毒(AMV),由两条肽链组成,具有聚合酶活性和很强的RNA酶H活性,它最适温度是42℃,最适pH8.3。在高反应温度时可消除mRNA的二级结构对逆转录的阻碍,然而高水平的RNA酶H的活性既抑制cDNA产生也限制其长度。另外,禽源逆转录酶制剂可被能切割DNA的核酸内切酶污染。
另一种来源于鼠白血病病毒(Mo-MLV),是单肽链的,有RNA聚合酶活性和相对较弱的RNA酶H活性,最适温度37℃,最适pH7.6,较弱的RNA酶H活性对获得2-3kb的mRNA的全长cDNA有很大好处。
在第一链反应前可用氢氧化甲基汞处理,破坏mRNA的二级结构,这一步对于最适反应温度较低(37)℃的鼠源逆转录酶催化的反应可能更为重要。临合成cDNA第一链之前加入过量的巯基试剂,可以使氢氧化甲基汞从RNA上解离。
2.单价阳离子 离子条件基本上影响各种模板的转录效率。用钾比用钠离子可获得较长的转录产物。对于cDNA长度的最适钾离子浓度为140-150mM。
3.二价阳离子 对于反转录酶活性来说,二价阳离子是必需的。低于4mM Mg2 未能观察到活性;产生全长转录产物的最适浓度是6-10mM。
4.脱氧核苷三磷酸 使用四种脱氧核苷三磷酸(dNTP)中每一种的高浓度对于有效合成cDNA是特别重要的。如果其中只有一种的浓度下降到10-50微摩尔以下,全长转录物的产量将明显下降。常用的dNTP的浓度为200-250微摩尔。
材料与方法
Ⅷ 人在冰棺里多少温度最合适
人在冰棺里-18℃最合适。
柜内温度可达-18℃。冰棺主要应用于尸体的冷藏,因此多被医院、殡仪馆、警察局、甚至是大众出租。冰棺在其特殊的行业中展现着其特有的作用。
最初我国并没有冰棺的制造技术,第一个冰棺的引入是在1925年。孙中山先生1925年逝世时,苏联政府于1925年3月30日来赠送过一个冰棺(也称玻璃盖钢棺),因孙先生已入殓,所以未使用。至今一直放在香山公园的孙中山纪念堂中。
相关如下:
冰棺材从外观看包括棺罩和箱体。棺罩是双层PC耐力板组成。内部饰以仿真鲜花,彩灯环绕。
箱体由外箱体和内箱体组成(外箱体主要有金属材料制作而成)。
内部制冷系统主要包括压缩机,冷凝器,蒸发器等部分。三个主要部分的共同工作达到制冷效果,从而保证机器内部温度低,保证尸体不腐。
Ⅸ RNA逆转录升温程序各阶段的作用
高温是解链和灭活反转录酶的 长久保存放-20
Ⅹ RNA是如何反转录成cDNA的过程和原理怎样请教
rna不纯化做反转录,cdna容易降解.
是的,得到的是全体mrna的cdna的库。然后通过pcr手段获得需要的目的片段。但是实际操作过程中,由于mrna的降解,因此一次实验不可能得到全部的cdna,因此要重复1~2次,才能保证全部mrna被反转录为cdna.
核糖核酸(缩写为rna,即ribonucleic
acid),存在于生物细胞以及部分病毒、类病毒中的遗传信息载体。rna由核糖核苷酸经磷酸二酯键缩合而成长链状分子。一个核糖核苷酸分子由磷酸,核糖和碱基构成。rna的碱基主要有4种,即a腺嘌呤、g鸟嘌呤、c胞嘧啶、u尿嘧啶,其中,u(尿嘧啶)取代了dna中的t。