‘壹’ 16SrDNA的16S rRNA
原核生物的rRNA含有3种类型:23S、16S、5SrRNA,它们分别含有2,900、1540和120个核苷酸,23S核苷酸含量过多,几乎是16S核苷酸含量的两倍,分析困难;而5S核苷酸又太少,没有足够的遗传信息,只有16S长度适中信息量较大且易分析。
在细菌的16SrDNA中有多个区段保守性,根据这些保守区可以设计出细菌通用物,可以扩增出所有细菌的16SrDNA片段,并且这些引物仅对细菌是特异性的,也就是说这些引物不会与非细菌的DNA互补,而细菌的16SrDNA可变区的差异可以用来区分不同的菌。因此,16SrDNA可以作为细菌群落结构分析最常用的系统进化标记分子。随着核酸测序技术的发展,越来越多的微生物的16SrDNA序列被测定并收入国际基因数据库中,这样用16SrDNA作目的序列进行微生物群落结构分析更为快捷方便。
‘贰’ 目前什么数据库最好用啊!
当今主流地数据库:SQL Serve、Oracle、IBM DB2
SQL Serve是Microsoft(微软)地数据库产品,Microsoft SQL Serve脱胎于Sybase SQL Serve。
Microsoft的SQL Serve针对不同用户群体的多个版本,易用性好。
企业版(SQL Serve 2005 Enterprise Edition)
最全面的版本,支持所有的SQL Serve 2005提供的功能。
标准版(SQL Serve 2005 Standard Edition)
适合于中小型的需求。
工作组版(SQL Serve 2005 Workgroup Edition)
入门数据库最好的选择
开发版(SQL Serve 2005 Enterprise Edition)
覆盖了标准版的功能,且能够生产应用程序,不允许作为生产系统。
评估版(SQL Serve 2005 Enterprise Edition)
有180天使用时间限制。
Oracle是Oracle(甲骨文)公司的数据库产品,Oracle数据库系统号称世界上最好地数据库系统,有很长地历史。Oracle成立于1977年,最初就是专门地数据库公司。
Oracle8加入了对象技术成为“关系-对象”型数据库系统。它地产品免费、服务收费。
Oracle数据库能适应70多种操作系统。
Oracle数据库成为世界上使用最广泛的数据库系统。
DB2是IBM 公司的产品,支持多操作系统、多种类型的硬件和设备。
这回知道了吧
‘叁’ 高通量测序16srrna基因序列用什么基因数据库比对比较好
silva最好,其次greengene(很久没更新了),rdp官网也提供数据库;还有ncbi 提供了人工矫正过的16s database。
‘肆’ 现在最好的数据库是那个数据库
最好学的一定不是最好的数据库。
最好的数据库不是最好用的数据库。
最好学的也不见得就是最好用的数据库。
Oracle和DB2算是目前商业应用最多的大型数据库。学好这个比较有前途和钱途。
SqlServer在中低端是一枝独秀。应用太大的情况下就会死的很惨,也算最好学的,毕竟学习资源较多,帮助也简便易用。
mysql是很好用的数据库,因为免费使用也不涉及版权问题。
sybase与informix虽然也都不错,可高一点搞不过oracle,低一点干不过sqlserver。informix最惨,都被收购了这么多年,它后续的支持和发展的情况大家都清楚。可怜啊,其实informix真的是很好用的数据库,虽然N次崩溃折腾过我无数通宵,长事务恨的我牙根痒痒
‘伍’ 将16s rRNA测序数据上传NCBI的SRA数据库,释放数据的时间选择最好是什么时候
一般上传数据到NCBI SRA的过程需要6步:
1、Create a BioProject for this research
2、Create a BioSample submission for your biological sample(s)
3、Gather Sequence Data Files
4、Enter Metadata on SRA website
a、Create SRA submission
b、Create Experiment(s) and link to BioProject and BioSample
c、Create Run(s)
5、Transfer Data files to SRA
6、Update Submission with PubMed links, Release Date, or Metadata Changes
需要注意的一点是,上传的过程中很多地方一旦保存或提交就不可以修改,尤其是各处的Alias。但是,可以联系NCBI的工作人员修改内容。NCBI的工作效率是很高的,一般不超过48小时,就可以得到确认,并拿到登录号。
‘陆’ 现在什么数据库比较好用呀
小点的access、visual foxpro,大型的就多了,sql server、oracle、my sql这几个比较常见,还有sybase、DB2等等。
‘柒’ 我想学数据库 哪个数据库更好呢Access还是SQL还是Oracle呢
对于初学者,我看还是sql吧。
其实你说sql,应该叫sqlserver吧,毕竟是windows上的,安装配置使用都好弄。oracle就比较啰嗦了。
至于access,可以不用考虑。你看看sqlserver,access也就差不多了。语句差别不大。
SQL,是一种标准,各家公司都按照SQl的标准,开发了自己的数据库产品。如Oracle公司的oracle,ms的sqlserver,Sybase公司的sybase,IBM的db2等等。所以以后不要说sql,要说sqlserver,因为oracle的语言也是sql.呵呵。
‘捌’ 学习数据库,现在用什么数据库比较好
FOX的话个人感觉已经过时了~只在一些小系统什么的用用吧
SQL SERVER的话微软的产品,虽然微软放出话来,数据库方面要超越ORACLE
但是个人感觉他也就放放话了,还是看好ORACLE
关于ORACLE的学习,个人意见,仅供参考,本人也在学习中。
下面这些都是我个人总结的。希望对你有帮助。
首先需要了解下 数据模型 关系数据库 DBMS 范式 自然运算 等等概念性的东西,可以去书店或者图书馆查阅相关书籍,可以了解下,没必要完全掌握,当然你要能掌握的话,那么对你的以后是非常有帮助的。
其实然后就是SQL标准 对象关系SQL 基本的SQL查询,以及最基本的SELECT/UPDATE/INSERT/DELETE语法,各种不同的数据库大同小异的。
然后就是不同的数据库,不同的用法,你也可以专学一门,比如ORACLE
或者MSSQL MYSQL INFORMIX DB2主要这几种~
这些入门了就可以学习嵌入数据库了,访问数据库的程序
以及数据库的性能优化,完整性,视图,安全 目录 备份 还原等等
当然主要学习ORACLE的话你也可以先直接挑本ORACLE入门看,类似ORACLE10G入门,ORACLE基础的书,不求完全懂,能看一点是一点,学习ORACLE是一个长期的过程,你在懂了一些后,再去看别的书,你会找到很多相同点,那时候就会有恍然大悟的感觉,一点点看就OK了~
到了一定的程度,你就知道自己怎么去学习,需要掌握些什么,像什么方向发展了。
另外在学习的过程中推荐有疑问的就自己做实验操作,或者去各大论坛像CSDN,CNOUG,ITPUB,CNBLOGS查找答案或者提问,也可以下载里面的基础区的教程了,不过大多是达人们整理出来的文档,也很不错的,尤其前面两个论坛你能学到很多东西的,不过还是推荐你先完整的看一本入门的后再说,不管理解了几成,有什么问题记下来,以后慢慢一点点解决。
ORACLE视频教程的话有个中科院的什么绝版培训教程oracle 10g的04年的视频,非常不错,迅雷上搜索中科院oracle 10g培训教程就能搜索到。
数据库开发工具的话 有TOAD(客户端连接工具),POWERDESIGN(数据库设计建模工具,), PL/SQL DESIGNER(PL/SQL开发工具),一般这3个就够用了,可以自己去迅雷搜索下载最新版本,另外的话还有一个叫DBATRIN,E/R 什么的工具,很多的,其实装了ORACLE客户端工具后,自带的JAVA控制台也很好用的。
当然你想一蹴而就的话,可以直接去网上找相关的ORACLE入门资料,那些都是些整理出来的条条,不过不推荐,最好多看书,多做实验。
‘玖’ 目前哪些数据库比较好各数据库的简单对比一下
没啥好不好的,看需求啦,需要什么就是什么好,各个数据库用途不太一样。比如mysql 不要钱,而且用起来也比较简单,三sqlserver 中小企业用着比较合适,oracle 大型企业会用,如果中小企业用它就会比较浪费,当然也不是光分企业,比如有些是数据型的公司,人家对数据要求高,也会选些严禁的数据库。db2的话很多银行都会用,安全性好。
‘拾’ 什么数据库比较好用
现在最好用的就是cache数据库了,它有这些特点:
1、速度快。Caché数据库在同等条件下查询相同数据比Oracle等普通数据库要快。原因是Caché数据库又叫做后关系型数据库(Post-Relation),顾名思义,Caché是基于普通关系型数据库如:Oracle, SQL server, Sybase等的基础之上并有所改进而产生的。
2、使用简单。Caché数据库支持标准SQL语句,因此不太熟悉M语言的用户依然可以轻易对数据库中的数据进行操作。
3、接口容易。Caché数据库支持ODBC标准接口,因此在与其他系统进行数据交换时非常容易。同时Caché亦可以将数据输出成文本文件格式以供其它系统访问调用。
4、真正的3层结构。
5、对象型编辑。Caché数据库是真正的对象型数据库,开发时用户可直接用数据库定义自己想要的对象,然后再在其它开发工具中调用该对象的方法和属性即可完成开发工作,非常方便;支持远程映射和镜像。
6、支持WEB开发。Caché数据库提供自带的Web开发工具,使用维护非常方便,符合当今软件业发展的趋势。
7、价格便宜。Caché数据库的价格比Oracle要便宜许多。