㈠ 转录组原始数据包括什么
转录组原始数据包括递交原始序列。
转录组有两部分数据要递交,首先是拼接的转录组序列,一般递交到tsa上,另一个是fastq的原始测序数据,一般递交到sra上。前两年还有论文只提交tsa不递交原始数据,目前发表的论文基本都要提交。这也是便于其他人可以完全重复你的实验和数据分析的必要要求。
简介
GSA(Genome Sequence Archive)是一个存储基因组、转录组以及其他Omics原始序列数据的数据库。GSA允许用户创建、上传并存储序列数据。GSA提供对项目信息(BioProject)、样本信息(BioSample)、实验信息(Experiment)以及测序数据的有效组织与管理。
㈡ 时间戳是什么,通俗解释
时间戳是指格林威治时间自1970年1月1日(00:00:00 GMT)至当前时间的总秒数。通俗的讲,时间型宴猛戳是一份能够表示一份数据在一个特定时间点已经存在的完整的可验证的数据。
时间戳(time-stamp)是一个经加密后形成的凭证文档,它包括三个部分:
1、需加时间戳的文件的摘要(digest);
2、DTS收到文件的日期和时间;
3、DTS的数字签名。
一般来说,时间戳产生的过程为:用户首先将需要加时间的文件用祥信Hash编码加密形成摘要,然后将该摘要发送到DTS,DTS在加入了收到文件摘要的日期和时间信息后再对该文件加密(数字签名),然后送回用户。
书面签署文件的时间是由签署人知己写上的,而数字时间戳则不然,它是有认证单位DTS来加的,以DTS收到文件的时间为依据。
(2)如何下载tsa数据库序列扩展阅读
《时间戳规范》的标准中规定了时间戳的保存、 时间戳的备份、 时间戳的检索、 时间戳的删除和销毁、 时间戳的查看和验卜桥证。
时间戳的保存包括在TSA (时间戳机构)方的保存和在用户方的保存。 在TSA方的保存涉及到时间戳数据库的管理和时间戳。
记录应当包含的信息项, 一般最少应包括入库时间、 序列号、 完整编码等。 时间戳在用户方一般由用户自行保存。
时间戳的备份在标准中规定了一系列要求, 如定期备份、 备份介质等。
时间戳的检索在标准中规定了至少三种检索方式, 包括分别按照入库时间、 序列号、 完整编码检索。
当TSA系统由于内部错误或者外部攻击导致产生错误的时间戳时, 标准规定了删除时应遵循的要求。 在确定某时间戳已经丧失其价值后, 标准规定了销毁时应遵循的要求。