ncbi包括的数据库有哪些

① 常用的医学数据库和网络医学资源有哪些

有MEDLINE、《中华医学杂志》、骨密度数据库、CBM、PubMed等。

1、MEDLINE

MEDLINE是美国国立医学图书馆(The National Library of Medicine, 简称NLM)生产的国际性综合生物医学信息书目数据库，是当前国际上最权威的生物医学文献数据库。

内容包括美国《医学索引》（Index Medicus, IM）的全部内容和《牙科文献索引》（Index to Dental Literature）、《国际护理索引》（International Nursing Index）的部分内容。

2、《中华医学杂志》

《中华医学杂志》是1915年创办的双语学术期刊，周刊，中国科学技术协会主管，中华医学会主办。

期刊主要反映中国医学最新的科研成果，积极推广医药卫生领域的新技术、新成果，及时交流防病治病的新经验。

3、骨密度数据库

2004 年11 月，GE 公司与中华医学会合作, 完成中国大陆骨密度正常值数据库项目，开创了中国骨密度发展的新时代，是中国医学界将临床问题数字化的一项巨大突破。

该项目的完成， 彻底结束了用其他人种的标准诊断中国人骨密度状况的混乱局面，树立了医生和患者对骨密度测量和骨质疏松定量诊断的信任。

4、CBM

CBM由中国医学科学院医学信息研究所/图书馆开发研制的中国生物医学文献服务系统（SinoMed）；

整合了中国生物医学文献数据库（CBM）、西文生物医学文献数据库（WBM）、北京协和医学院博硕学位论文库等多种资源，是集检索、免费获取、个性化定题服务、全文传递服务于一体的生物医学中外文整合文献服务系统。

可访问中国生物医学文献数据库（CBM）资源 ，北京协和医学院博硕学位论文库（每篇论文的前30页内容）。

CBM收录1978以来1600余种中国生物医学期刊，以及汇编、会议论文的文献题录530余万篇，全部题录均进行主题标引和分类标引等规范化加工处理。年增文献40余万篇，每月更新。

5、PubMed

PubMed 数据库是美国国立医学图书馆(National libraryof Medicine， NLM) 的国家生物技术信息中心(National Center for Biotechnology Information，NCBI)研制开发的， 设在国家健康研究院。

PubMed 数据库收录MEDLINE， PRE-MEDLINE， 还有其它如《Science》， 《Nature》 等电子期刊构成的数据库。 自1996年至今，该数据库收录约1000 万篇生物医学文献。

可供检索的专业为，分子生物学及NCBI 部分的数据库题录。它收录了美国和另外70 个国家出版的生物医学期刊约3900种。

PubMed 网上更新速度是每周1次。Medline 收录的大多数论文原始语种是英语， 或有英文摘要。

参考资料来源：网络——医学数据库

② NCBI有多少数据库，分别有什么作用

在生物医学信息学领域，数据库和服务的定义与计算机领域有很大的不同，如果要问NCBI过去，现在或将来会有多少数据库，恐怕连NCBI自己都说不清楚。要是一个一个数据库讲下来，9999个字肯定不够用。这里有一个列表供您参考http://www.ncbi.nlm.nih.gov/guide/all/。

NCBI的产生和发展是在美国和全球生物学高速发展，高通量数据急速产生，而缺乏有效的数据分析方法的背景下产生，起初它主要任务是数据的存储和查询。只不过其存储的数据大多以高通量数据为主，例如基因测序，基因组，SNP, 基因芯片,小分子化合物和GWAS数据等。这些数据的共享，极大地促进了生物信息学发展。

按照数据->样式->知识->智慧的发展模式，NCBI主要起到了一个为生物学家提供数据的角色。不过，NCBI目前也不断地在调整自己的角色。例如，生物医学文献。NCBI在从NLM继承过来的pubmed的基础，提供以PMC数据库为核心的全文文献服务。PubMed数据库应该是全球生物学家使用频率最高的数据库。NCBI最近对pubmed的改版，虽然没有实质性的改变，但其按照用户体验进行的修改，足见其对该数据库的重视。

另外，NCBI目前不断地在引入高学历生物学人才对其数据库的质量进行控制。以dbSNP为例，其正在通过与领域专家的合作将突变数据与人类表型数据进行关联。

总得来讲，NCBI的发展是与生物学高通量数据产生密切相关，它以经不在局限于提供数据存储与查询，其未来的发展必将发展为一个大型的、综合的知识库。到那时NCBI会不会免费，就要另当别论了。很显然没有人会将自己的手稿拱手让人。如果真有那么一天，不知道从中会产生多少专利和知识产权。

③ NCBI是什么主要是做什么

NCBI是National Center for Biotechnology Information的缩写，指美国国家生物技术信息中心，建立于1988年。

NCBI的初衷是为了给分子生物学家提供一个信息储存和处理的系统。除了建有GenBank核酸序列数据库（该数据库的数据资源来自全球几大DNA数据库，其中包括日本DNA数据库DDBJ、欧洲分子生物学实验室数据库EMBL以及其它几个知名科研机构）之外，NCBI还可以提供众多功能强大的数据检索与分析工具。

(3)ncbi包括的数据库有哪些扩展阅读：

NCBI提供的资源有Entrez、Entrez Programming Utilities、My NCBI、PubMed、PubMed Central、Entrez Gene、NCBI Taxonomy Browser、BLAST、BLAST Link (BLink)、Electronic PCR等共计36种功能，而且都可以在NCBI的主页www.ncbi.nlm.nih.gov上找到相应链接，其中多半是由BLAST功能发展而来的。

已故参议员克劳德·佩珀认识到计算机化信息处理方法对于进行生物医学研究的重要性以及赞助立法，该立法于1988年11月4日成立了国家生物技术信息中心（NCBI），作为国家医学图书馆的一个部门（NLM） ）在美国国立卫生研究院（NIH）。

④ 高通量测序数据公共数据库有哪些

我原来常用的：

NCBI：持有INSDC的节点。网站上有核酸、蛋白、基因名、基因组名等等的搜索工具，以及BLAST序列比对搜索工具，PUBMED文献数据库，Taxonomy数据，COG蛋白家族库等等。FTP可以下到它全部的数据库，BLAST的单机程序，以及各种工具程序。

EBI：和NCBI类似，欧洲搞的对等物。感觉EBI网站比NCBI要清楚简洁。另外EBI网站整合了更多的工具，比如多序列比对。

Uniprot：全蛋白库。NCBI和EBI的蛋白库来源于此。目前包括两部分：SwissProt是人工校对过的，TrEMBL是自动校对的。

Pfam：蛋白家族库。可以使用配套的HMMER进行搜索。比BLAST能找到更远缘的东西，而且找到的东西是结构域。
Rfam：RNA的，类似Pfam。