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pubchem有多少3d数据

发布时间:2023-03-25 11:15:06

㈠ pubchem怎么查物质上合成路线

pubchem怎么查物质上合成路线?PubChem数据库包括 3个子数据库(可集成在一起检索,也可以单独检索):

PubChem BioAssay (化合物)--用于存储生化实验数据,实验数据主要来自高让首通量筛选实验和科技文坦仿数献;

PubChem Compound (物质) --用于存储整理后的化合物化学结构信息;

PubChem Substance (生物检测剂)--用于存储机构和个人上传的化合物原始数大锋据。

PS:习惯使用PubChem Entrez的用户,在新的PubChem主页搜索时可以勾选指向Entrez的链接。

㈡ chem3d如何查看分子模型大小

chem3d查看分子模型大小步骤如下。
1、建立苯模型。
2、执行【View】旦销【高好ConnollyMolecular】弹出Suface对话框。
3、solid】选项模念游可以选择分子表面的类型。
4、Resolution】滑动到右边,其值为100。

㈢ chem3D画出来的结构图怎么导出3D文件,要能插入word里面的

你需要先将ChemDraw中页面大小设置成跟你的结构式一样大小,或者更具体点,你投稿的格式激睁要求中,结构是的大小是多大,就将ChemDraw中页面大小设置成多大明唯岁。比如,宽度不超过 8.5 cm。山灶
然后画结构式,注意,画结构式的时候选择ChemDraw菜单栏上的 File ——> Apply Document Settings from ——> ACS Document 1996 ,或者根据你投稿的期刊选择相应的格式。
画好结构式之后就可以 Ctrl + C, Ctrl + V 粘贴到Word 文档了。

㈣ PubChem与NCBI是什么关系

现在PubChem被整合进此扒了NCBI,作洞扒迹纳并为NCBI一个子项存在。

http://pubchem.ncbi.nlm.nih.gov/

㈤ 氯苯可以被还原吗

氯苯为无色液体,沸点132.2℃。第一次世界大战期间主要用于生产军用炸药所需的苦味酸。1940年到1960年间,大量用于生产滴滴涕(DDT)杀虫剂。1960年后,DDT逐渐被高效低残毒的其他农药所取代,氯苯的需求量日趋下降。主要用做乙基纤维素和许多树脂的溶剂,生产多种其他苯系中间体,如硝基氯苯等。
基本介绍
中文名:氯苯
英文名:Chlorobenzene
别称:苯基氯、氯代苯、氯化苯、一氯代苯
化学式:C6H5Cl
CAS登录号:108-90-7
熔点:-45℃
沸点:132.2℃
水溶性:0.049g/100g水(30℃)
密度:1.11 g/cm3
闪点:29℃
安全性描述:S:24/25-61
危险性描述:R:10-20-51/53
基本信息
中文名称:氯苯
中文别名:氯代苯,一氯代苯,氯化苯;氯化苯;
英文名称:chlorobenzene
英文别名:monochloro-benzene;Chlorobenzene;Chloroacetic anhydride;
CAS号:108-90-7
分子式:C6H5Cl
分子量:112.55700
精确质量:112.00800
LogP:2.34000
安全信息
符号:GHS02GHS07GHS09
信号词:警告
危害声明:H226; H315; H332; H411
警示性声明:P210; P261; P370 + P378
包装等级:III
危险类别:3
海关编码:2903919090
危险品运输编码:UN 1134 3/PG 3
WGK Germany:2
危险类别码:R10; R20; R51/53
安全说明:S24/25-S61-S36/37-S45
RTECS号:CZ0175000
危险品标志:Xn
编号系统
CAS号:108-90-7
MDL号:MFCD00000530
EINECS号:203-628-5
RTECS号:CZ0175000
BRN号:605632
PubChem号:24857162
物理性质
外观与性状:无色透明液体,具有苦杏仁味。
熔点(℃):-45.2
相对密度(水=1):1.10
沸点(℃):132.2
相对蒸气密度(空气=1):3.9
饱和蒸气压(kPa):1.33(20℃)
临界温度(℃):薯粗携359.2
临界压力(MPa):4.52
辛醇/水分配系数的对数值:2.84
闪点(℃):28
爆炸上限%(V/V):9.6
引燃温度(℃):590
爆炸下限%(V/V):1.3
溶解性:不溶于水,溶于乙醇、乙醚、氯仿、二硫化碳、苯等多数有机溶剂。
生态学数据
1.生态毒性:LC50:39~73mg/L(96h)(鱼)
2.生物降解性:
好氧生物降解(h):1632~3600
厌氧生物降解(h):6528~14400
3.非生物降解性:
水解最大光吸收波长范围(nm):215.5~265
水中光氧化半衰期(h):1553~62106
空气中光氧化半衰期(h):72.9~729
一级水解半衰期:>879a
4.其他有害作用:该物质对环境有严重危害,应特别注意对地表水、土壤、大气和饮用水的污染。
分子结构数据
1、摩尔折射率:31.14
2、摩尔体积(cm3/mol):101.3
3、等张比容(90.2K):243.1
4、表面张力(dyne/cm):33.0
5、极化率:12.34
计算化学数据
1.不确定化学键立构中心数伏数量:0
2.氢键供体数量:0
3.氢键受体数量:0
4.可旋转化学键数量:0
5.共价键单元数量:1
6.拓扑分子极性表面积0
7.重原子数量:7
8.表面电荷:0
9.复杂度:46.1
10.同位素原子数量:0
11.确定原子立构中心数量:0
12.不确定原子立构中心数量:0
13.确定化学键立构中心数量:0
性质与稳定性
1.化学性质:性质稳定,常温常压下不受空气、水分和光的作用,长时间煮沸也不发生分解。常温下与凳雀水蒸气、硷、盐酸、稀硫酸等也不发生反应。氯苯蒸气通过红热的铂丝或铁管时生成4,4’-二氯联苯、联苯、4-氯联苯等。在高温高压下与氢氧化钠溶液作用,或在常压和催化剂存在下与水蒸气作用则水解为苯酚。与氨气不作用,但在高温高压和铜催化剂存在下,与浓氨水反应生成苯胺。与浓硝酸和浓硫酸的混合物在0℃时发生硝化反应,以7:3的比例生成对氯硝基苯和邻氯硝基苯。与热浓硫酸易发生磺化反应,生成对氯苯磺酸。用镍作催化剂加氢还原生成苯和联苯,在沸腾的醇存在下与钠或钠汞齐反应也生成联苯。以三氯化铁为催化剂进行氯化反应,生成邻二氯苯和对二氯苯的混合物。与溴加热主要生成对溴氯苯。与熔融的三溴化铝反应生成溴苯。与碘的反应缓慢。与一般的氟化剂不生成氟苯。在发烟硫酸存在下与三氯乙醛缩合,生成二氯二苯基三氯乙烷(DDT)。
2.稳定性:稳定
3.禁配物:强氧化剂、过氯酸银、二甲亚砜
4.聚合危害:不聚合
5.分解产物:氯化物
贮存方法
储存注意事项:储存于阴凉、通风的库房。远离火种、热源。库温不宜超过37℃。保持容器密封。应与氧化剂分开存放,切忌混储。采用防爆型照明、通风设施。禁止使用易产生火花的机械设备和工具。储区应备有泄漏应急处理设备和合适的收容材料。
作用与用途
1.用作染料、医药、农药、有机合成的中间体。还用于制取溶剂和橡胶助剂,油漆,快干墨水及干洗剂等。
2.用作硝基喷漆、涂料及清漆的溶剂。工业上用作制造苯胺、苯酚、苦味酸、染料、医药、香料、杀虫剂等的原料。
3.用作溶剂,气相色谱参比物,用于有机合成,也用于电子工业产品和原料检验。
4.作为有机合成的重要原料。
使用注意事项
危险性概述
健康危害:对中枢神经系统有抑制和麻醉作用;对皮肤和黏膜有刺激性。急性中毒:接触高浓度可引起麻醉症状,甚至昏迷。脱离现场,积极救治后,可较快恢复,但数日内仍有头痛、头晕、无力、食欲减退等症状。液体对皮肤有轻度刺激性,但反复接触,则起红斑或有轻度表浅性坏死。慢性中毒:常有眼痛、流泪、结膜充血;早期有头痛、失眠、记忆力减退等神经衰弱症状;重者引起中毒性肝炎,个别可发生肾脏损害。
环境危害:对环境有严重危害,对水体、土壤和大气可造成污染。
燃爆危险:该品易燃,具刺激性。
急救措施
皮肤接触:脱去污染的衣着,用肥皂水和清水彻底冲洗皮肤。
眼睛接触:提起眼睑,用流动清水或生理盐水冲洗。就医。
吸入:迅速脱离现场至空气新鲜处。保持呼吸道通畅。如呼吸困难,给输氧。如呼吸停止,立即进行人工呼吸。就医。
食入:饮足量温水,催吐,就医。
消防措施
有害燃烧产物:一氧化碳、二氧化碳、氯化物。
灭火方法:喷水冷却容器,可能的话将容器从火场移至空旷处。
灭火剂:雾状水、泡沫、干粉、二氧化碳、砂土。
泄漏应急处理
应急处理:迅速撤离泄漏污染区人员至安全区,并进行隔离,严格限制出入。切断火源。建议应急处理人员戴自给正压式呼吸器,穿防毒服。尽可能切断泄漏源。防止流入下水道、排洪沟等限制性空间。
小量泄漏:用砂土或其它不燃材料吸附或吸收。也可以用不燃性分散剂制成的乳液刷洗,洗液稀释后放入废水系统。
大量泄漏:构筑围堤或挖坑收容。用泡沫覆盖,降低蒸气灾害。用防爆泵转移至槽车或专用收集器内,回收或运至废物处理场所处置。
操作处置与储存
操作注意事项:密闭操作,局部排风。操作人员必须经过专门培训,严格遵守操作规程。建议操作人员佩戴自吸过滤式防毒面具(半面罩),戴化学安全防护眼镜,穿防毒物渗透工作服,戴橡胶耐油手套。远离火种、热源,工作场所严禁吸菸。使用防爆型的通风系统和设备。防止蒸气泄漏到工作场所空气中。避免与氧化剂接触。灌装时应控制流速,且有接地装置,防止静电积聚。搬运时要轻装轻卸,防止包装及容器损坏。配备相应品种和数量的消防器材及泄漏应急处理设备。倒空的容器可能残留有害物。
储存注意事项:储存于阴凉、通风的库房。远离火种、热源。库温不宜超过30℃。保持容器密封。应与氧化剂分开存放,切忌混储。采用防爆型照明、通风设施。禁止使用易产生火花的机械设备和工具。储区应备有泄漏应急处理设备和合适的收容材料。
毒理学资料
急性毒性:LD502290mg/kg(大鼠经口);1445mg/kg(小鼠经口)
亚急性和慢性毒性:动物亚急性毒性反应有肺、肝、肾病理组织学改变。
污染来源:氯苯可用于电子工业产品和原料的检验。用作洗涤、醋酸纤维素、人造树脂、油类、脂类的溶剂。用于生产苯胺、杀虫剂、酚及氯代硝基苯。还可用于制造油漆、橡胶助剂和快干墨水。氯苯还是制造染料、有机合成和许多农药的中间体。从事氯苯生产或使用氯苯的企业,以及在运输等过程中,由于操作和管理失误,均可构成氯苯的污染。
由于氯苯具有很强的挥发作用,通常在水和土壤中的氯苯会很快的挥发到空气中,因此水和土壤中的氯苯会很快降低到很低的水平。氯苯在空气中的光解速度在20小时之内会降低一半,在水中的氯苯将产生水解作用。因此,受氯苯污染的水和土壤能较快地得到恢复。
物质毒性
编号
毒性类型
测试方法
测试对象
使用剂量
毒性作用
1
急性毒性
口服
大鼠
1110 mg/kg
1.行为毒性——嗜睡
2.行为毒性——震颤
3.行为毒性——共济失调
2
急性毒性
吸入
大鼠
2965 ppm
详细作用没有报告除致死剂量以外的其他值
3
急性毒性
腹腔注射
大鼠
1655 mg/kg
详细作用没有报告除致死剂量以外的其他值
4
急性毒性
口服
小鼠
2300 mg/kg
详细作用没有报告除致死剂量以外的其他值
5
急性毒性
吸入
小鼠
15 gm/m3
详细作用没有报告除致死剂量以外的其他值
6
急性毒性
腹腔注射
小鼠
515 mg/kg
详细作用没有报告除致死剂量以外的其他值
7
急性毒性
口服

2250 mg/kg
详细作用没有报告除致死剂量以外的其他值
8
急性毒性
皮肤表面

>2200 mg/kg
详细作用没有报告除致死剂量以外的其他值
9
急性毒性
口服
豚鼠
2250 mg/kg
详细作用没有报告除致死剂量以外的其他值
10
急性毒性
皮肤表面
豚鼠
>11 mg/kg
详细作用没有报告除致死剂量以外的其他值
11
急性毒性
腹腔注射
豚鼠
4100 mg/kg
1.行为毒性——肌肉无力
2.肝毒性——肝豆状核变性
3.肾、输尿管和膀胱毒性——其他变化
12
急性毒性
口服
哺乳动物
2300 mg/kg
详细作用没有报告除致死剂量以外的其他值
13
急性毒性
吸入
哺乳动物
10 gm/m3
详细作用没有报告除致死剂量以外的其他值
14
急性毒性
未报告
哺乳动物
2300 mg/kg
详细作用没有报告除致死剂量以外的其他值
15
慢性毒性
口服
大鼠
14 mg/kg/14D-I
1.行为毒性——嗜睡
2.慢性病相关毒性——死亡
16
慢性毒性
口服
大鼠
32500 mg/kg/13W-I
1.肝毒性——肝重量发生变化
2.生化毒性——抑制或诱导肽酶
3.慢性病相关毒性——死亡
17
慢性毒性
口服
大鼠
27300 ug/kg/39W-I
1.血液毒性——红细胞染色异常或影响有核红细胞
2.血液毒性——嗜酸性粒细胞增多
3.血液毒性——红细胞计数发生变化
18
慢性毒性
吸入
大鼠
1 mg/m3/60D-C
1.大脑毒性——影响特定区域的中枢神经系统
2.生化毒性——抑制或诱导胆硷酯酶
3.生化毒性——凝血功能异常
19
慢性毒性
吸入
大鼠
250 ppm/7H/24W-I
1.肝毒性——肝重量发生变化
2.血液毒性——其他变化
3.生化毒性——抑制转氨酶活性、改变了转氨酶空间结构
20
慢性毒性
口服
小鼠
16250 mg/kg/13W-I
1.肝毒性——肝炎 (肝细胞坏死),扩散
2.肾、输尿管和膀胱毒性——尿中成分发生变化
3.慢性病相关毒性——死亡
21
慢性毒性
口服

17712 mg/kg/93D-I
1.血液毒性——白细胞计数发生变化
2.生化毒性——抑制转氨酶活性、改变了转氨酶空间结构
3.慢性病相关毒性——死亡
22
慢性毒性
口服

441 mg/kg/63W-I
1.胃肠道毒性——胃炎
2.肝毒性——肝炎 (肝细胞坏死),带状
3.肾、输尿管和膀胱毒性——肾小管发生变化 (包括急性肾功能衰竭,急性肾小管坏死)
23
慢性毒性
吸入

250 ppm/7H/24W-I
1.肝毒性——肝重量发生变化
2.血液毒性——血清成分发生变化 (如TP、胆红素、胆固醇)
3.生化毒性——抑制转氨酶活性、改变了转氨酶空间结构
24
慢性毒性
口服
豚鼠
441 mg/kg/63W-I
1.胃肠道毒性——胃炎
2.肝毒性——肝炎 (肝细胞坏死),带状
3.肾、输尿管和膀胱毒性——肾小管发生变化 (包括急性肾功能衰竭,急性肾小管坏死)
25
突变毒性
酿酒酵母
1000 ppm
26
突变毒性
腹腔注射
小鼠
225 mg/kg/24H
27
突变毒性
小鼠淋巴细胞
70 mg/L
28
突变毒性
腹腔注射
小鼠
1 mg/kg
29
突变毒性
小鼠淋巴细胞
100 mg/L
30
突变毒性
仓鼠卵巢
300 mg/L
31
致癌性
口服
大鼠
61800 mg/kg/2Y-I
1.致癌性——肿瘤(根据RTECS标准)
2.肝毒性——肿瘤
3.血液毒性——肿瘤
32
生殖毒性
吸入
大鼠
75 ppm/6H,雌性受孕 6-15 天后
1.生殖毒性——肌肉骨骼系统发育异常
33
生殖毒性
吸入
大鼠
210 ppm/6H,雌性受孕 6-15 天后
1.生殖毒性——肝胆系统发育异常
34
生殖毒性
吸入

590 ppm/6H,雌性受孕 6-18 天后
1.生殖毒性——植入后死亡率增加
35
生殖毒性
吸入

10 ppm/6H,雌性受孕 6-18 天后
1.生殖毒性——肌肉骨骼系统发育异常
制备
直接氯化法
用苯直接氯化制氯苯的方法,是英国于1909年首先进行工业化生产的,并一直沿用至今。反应式为:有气相法和液相法两种。
直接氯化法反应方程式
直接氯化法反应方程式
①气相法,反应温度400~500℃,成本高于液相法,故已被淘汰。
②液相法,通常用三氯化铁催化,但在生成氯苯的同时,还伴有多氯苯生成。其相对速度常数如下:
从以上的相对速度常数可知,如能在反应过程中维持苯有较高的浓度,而使氯苯的浓度较低,则可控制多氯苯的生成。为此可采用多釜串联或接近活塞流的管式反应器连续操作。氯化是放热反应,可用载热体移出反应热。但更好的方法是使反应在液体的沸点下进行。此时,一部分过量的苯和少量氯苯气化,带走大量热量,可使反应器的生产能力增加。反应产物中含有氯化氢,在蒸馏前要用氢氧化钠溶液中和。
氧氯化法
由德国拉西公司于1932年开发成功。其反应式为:
氧氯化法反应方程式
氧氯化法反应方程式
反应是在275℃和常压下于气相中进行的,催化剂为铜-氧化铝。为了抑制多氯苯的生成,所用的苯需大大过量。尽管如此,还会生成5%~8%的二氯苯,而氯化氢被全部用完。
本法主要是在拉西法制苯酚过程中套用,由于拉西法制苯酚已被淘汰,此法也不再采用。

㈥ chemdraw 怎么添加立体化学参数

这里以更改Chem 3D模型的化学参数值为例,
Chem 3D是ChemOffice 15.1中专门用于绘制三维结构和立体模型的组件,通过应用该组件用户可以绘制Chem
3D模型并计算化学数据。Chem
3D组件中有自己默认的化学结构参数,如果用户想绘制特别图形的话可以在绘制过程中的任何阶段更改模型设置。为了帮助困惑中的使用者们,本节
ChemDraw使用技巧将教各位如何更改默认的ChemDraw三维模型设置。

更改ChemDraw模型参数的步骤:

步骤一:打开ChemOffice 15.1的Chem 3D组件,选择File菜单并单击Model Settings(模型设置)命令,随即就会弹出模型参数设置对话框。

步骤二:模型参数设置对话框中主要有六大种类的选项卡,包括Colors&Fonts(颜色和字体)、
Stereo&Depth(立体和深度)、Background(背景)、Model Display(模型显示)、Model
Building(模型构建)、Atom&Bond(原子和键)。腊游总的来说,模型参数设置对话框能够控轮大销制几乎全部的Chem
3D默认选项,包括原子球的大小、原子扩展空间大小、化学键的粗细、H原子和H氢键以及孤对电子显示控制、是否显示元素符号和编号、模型的显示方式、模型
构造、字体大小和颜色等,根据用户需要更改参数来选择对应的选项卡。

步骤三:在对的选项卡中选择需要更改的项目,最后单击OK按钮即可,如果用户不确定更改后的效果是否满意可以在单击OK按钮前先勾选右下角的”Preview“复选框进行预览。

温馨提示:在模型参数设置对话框的左下方有两个按钮,它们的作用不一致。Reset to Default按钮是取消当前设置并将参数恢复仿薯到原始默认值,Set as Default按钮是将当前参数设置为默认值,未来绘制化学立体图形将以此为默认值。
chemdraw参照以上方法就可以了,教程索引自http://www.chemdraw.com.cn/ruheshiyong/moxing-canshu.html。

㈦ 为什么环糊精包合物ph很难调

光甘草定是光果甘草特有的疏水性异黄酮类化合物,含量为0.1%~0.3%,具有抗色素异常沉积、抗氧化、抗细胞增殖、抗炎、增强记忆力、抗骨质疏松和抗菌等多种生物活性。GLD难溶于水(7 μg/mL,25 ℃),导致其在体内胃肠道中的溶出率低、吸收和生物利用率差,在水溶性基质的食品和药品等相关领域的应用也因此受到极大的限制。因此,提高GLD在水中的溶解度是开发其潜在应用价值的关键所在。

环糊精是直链淀粉在由芽孢杆菌产生的葡萄糖基转移酶作用下生成的一系列环状碳水化合物的总称,最常见的是α-、β-、γ-CD,分别由6~8 个葡萄糖单元通过α-1,4-糖苷键连接而成。CD各葡萄糖单元的2、3、6位羟基由不同的官能团取代,可得到一系列衍生物,如6-羟丙基-β-环糊精(、2,6-二甲基-β-环糊精和2-磺丁基-β-环糊精等。CD及其衍生物均具有一个由亲水的外表面和相对疏水的中心空腔构成的圆筒式结构,这种独特的结构特性使CD能够通过非共价力(范德华力、静电相互作用和氢键)与多种化合物尤其是疏水性化合物相互作用,将后者包合在空腔中,形成主-客体包合物,从而提高难溶性化合物的溶解度,进而提高在体内的吸收及生物利用率。空腔大小和取代基的种类是影响CD及其衍生物对客体包合能力竖圆的重要因素。

本研究通过分子对接和相溶解度结合的念纤稿方法筛选出适宜包合GLD的CD,并进行固体包合物的制备;考察不同干燥方法、不同投料比对固体包合物的包合率、载药量和溶解度的影响;采用扫描电子显微镜法、差示扫描量热法、傅里叶变换红外光谱法和分子对接技术对固体包合物的形貌、GLD的存在形式、GLD与2-SBE-β-CD的相互作用和空间构象等结构表征进行分析;并在此基础上进一步研究GLD/2-SBE-β-CD固体包合物的体外溶出特性及GLD/2-SBE-β-CD固体包合物对HepG-2细胞增殖的抑制作用。

1 材料与方法
1.1 材料与试剂
GLD 泌阳草木青生物科技有限公司;2-SBE-β-CD、6-HP-β-CD 湖北恒硕化工有限公司;α-CD、β-CD、γ-CD、2,6-M-β-CD、噻唑蓝(methylthiazolyl tetrazolium,MTT) 上海源叶生物科技有限公司;无水乙醇、乙腈、石油醚、二甲基亚砜(dimethyl sulfoxide,DMSO) 天津市德恩化学试剂有限公司;溴化钾 天津市科密欧化学试剂有限公司;铝坩埚上海菁仪化工材料有限公司;DMEM培养基 美国Fetal Bovine Serum生物科技有限公司;胎牛血清 江苏恩莫阿赛科技有限公司;胰消化酶 合肥Biosharp科技有限公司;HepG-2细胞 ATCC细胞库。

1.2 仪器与设备
SCIENTZ-10N冷冻干燥机 宁波新芝生物科技股份有限公司;pHS-3C pH计、L5S紫外分光光度计上海仪电科学仪器股份有限公司;TENSPOR27 FTIR仪德国Bruker仪器公司;DSC1型DSC仪 瑞士Mettler-Toledo公司;6000Y型喷雾干燥机 上海Bilon仪器有限公司;TM3030 SEM 日本日立高新技术公司;E191IR恒温培养箱 美国西蒙公司;CKX41SF倒置电子显微镜 日本Olympus公司;SW-CJ-2FD双人单面超净工作台 苏州净化设备有限公司;RS-232C酶标仪 美国Bio-Rad公司。

1.3 方法
1.3.1 CD的筛选
通过分子对接技术和相溶解度法测定不同种类CD与GLD的包合能力及稳定性,筛选适宜包合GLD的CD。

1.3.1.1 分子对接法
从PubChem数据库下载GLD的3D模型(CID编号为124052),用Gaussian 09软件中的DFT方法(B3LYP/6-31G)对3D模型进行优化。α-CD、β-CD和γ-CD的3D模型从剑桥晶体数据库得到,编号分别为1106001、1107194和1529141。用Gauss View 5.0软件打开去水后的β-CD模型,用相应的取代基将葡萄糖单元中对应2,3,6位取代,得到β-CD衍生物模型;其中,2,6-M-β-CD、单-6-氨基-β-CD、三乙酰基-β-CD的取代度分仔孝别为14、1、21,其他β-CD衍生物取代度均为7;用Gaussian 09软件半经验算法中的PM6基组对β-CD衍生物模型的几何构型进行优化。

采用AutoDockTools 4.2软件处理受体(α-CD、β-CD、γ-CD及β-CD衍生物(6-HP-β-CD、2,6-M-β-CD、2-SBE-β-CD、6-硫酸盐-β-CD、单-6-氨基-β-CD、6-羧甲基-β-CD、三乙酰基-β-CD、6-季铵-β-CD))与配体(GLD),添加H原子与原子电荷,并设置GLD分子内可旋转单键数量及根原子。将设置好的受体和配体保存为pdbqt格式。在分子对接过程中,均以受体几何中心为中心,建立尺寸为60 Å×60 Å×60 Å的反应约束盒子。搜索参数选用拉马克遗传算法,算法对接的轮数设为100,能量评估的最大数目设为250 000,其他参数取默认值。对接方法采用半柔性对接。

1.3.1.2 相溶解度法
根据1.3.1.1节计算机模拟得到的结果选择恰当的β-CD衍生物用于本实验。准确称取适量α-CD、β-CD、γ-CD及β-CD衍生物,用去离子水配制浓度分别为0、10、20、30、40、50 mmol/L的CD溶液;其中,β-CD和α-CD溶解度较小,配制其溶液浓度为0、2、4、6、8、10 mmol/L。向上述不同浓度的CD溶液中加入过量的GLD,置于恒温振荡器中,25 ℃、200 r/min避光条件下孵育24 h。取出样品溶液,5 000 r/min离心5 min,取上清液。用80%乙醇溶液(V/V)适当稀释,在281 nm波长处测其吸光度,计算GLD的浓度。以CD浓度为横坐标,GLD浓度为纵坐标,绘制相溶解度图。

1.3.2 GLD/CD固体包合物的干法制备
采用捏合法制备固体包合物。将GLD与筛选出最适宜的CD按物质的量比1∶1称量。用2 倍CD质量的去离子水溶解CD,研磨均匀。用无水乙醇溶液溶解GLD,配制成30 mg/mL的GLD乙醇溶液。将GLD乙醇溶液全部滴加到CD溶液中,研磨45 min,60 ℃烘箱中干燥至质量恒定,得到固体包合物。

1.3.3 GLD/CD固体包合物的湿法制备
将GLD与筛选出最适宜的CD按的物质的量比1∶1称量。用去离子水溶解CD,配制成0.04 mol/L的CD溶液。用少量无水乙醇溶解GLD,配制成30 mg/mL的GLD乙醇溶液。将GLD乙醇溶液加入到CD溶液中,使体系中乙醇体积分数为30%,于25 ℃、200 r/min的条件下振荡24 h。分别将所得溶液用冷冻干燥法、喷雾干燥法和共蒸发干燥法进行干燥,制备固体包合物。

将GLD与CD按物质的量比1∶1.5和1.5∶1称量,重复上述操作,经冷冻干燥后,得到不同投料比的固体包合物。

1.3.3.1 冷冻干燥法
用45 ℃的旋转蒸发器除去所得溶液中的乙醇,将溶液置于-20 ℃冰箱中预冻12 h。置于冷冻干燥机中冻干后,过80 目筛。

1.3.3.2 喷雾干燥法
用45 ℃的旋转蒸发器除去所得溶液中的乙醇。将溶液置于喷雾干燥器中干燥,采用1 mm的加压雾化器,进样速度2.3 mL/min,进风温度180 ℃,排风温度110 ℃,雾化气流速度3.9 m3/min。

1.3.3.3 共蒸发干燥法
将所得溶液置于60 ℃的旋转蒸发器中旋转蒸发至干。

1.3.4 GLD/CD固体包合物饱和溶解度的测定
分别在1 mL去离子水中加入过量的经不同制备方法得到的GLD/CD固体包合物,在室温条件下超声溶解至平衡状态。0.45 μm滤膜过滤,用80%乙醇溶液逐步稀释滤液到合适浓度(稀释10 000 倍)。在281 nm波长处测定吸光度,计算GLD的含量,即为饱和溶解度。

1.3.5 GLD/CD固体包合物包合率和载药量的测定
分别称取两份10 mg经不同制备方法得到和不同投料比的GLD/CD固体包合物。一份溶于1 mL去离子水中,加入9 mL乙腈25 ℃超声处理20 min。5 000 r/min离心5 min后,收集上清液,用乙腈稀释10 倍。测定其在281 nm波长处的吸光度,根据标准曲线计算GLD的质量,即为包合物样品中GLD总质量。

另一份加入400 μL石油醚,充分混匀。5 000 r/min离心5 min,去上清液(用来洗去未被包合的GLD),重复洗2 次,置于烘箱中使石油醚挥发。按上述包合物样品中GLD总质量的测定步骤测定此样品中的GLD质量,即被包合的GLD质量。

1.3.6 GLD/CD固体包合物及相关样品的结构表征
1.3.6.1 SEM分析
对GLD、CD、GLD/CD物理混合物(以质量比1∶100混合均匀)及经不同制备方法得到的GLD/CD固体包合物进行扫描电子显微镜测试。用导电双面胶将样品固定在样品台上,喷镀铂金后在3 kW条件下,分别于300、400、1 200 倍观察样品的表面形态。

1.3.6.2 DSC分析
分别称取GLD、CD、GLD/CD物理混合物及经不同制备方法得到的GLD/CD固体包合物各5 mg,温度扫描范围25~300 ℃,升温速率10 ℃/min,氮气流量10 mL/min,以空盘作为参比,记录各样品的DSC图线。

1.3.6.3 FTIR分析
分别称取适量的GLD、CD、经不同制备方法得到的GLD/CD固体包合物和GLD/CD物理混合物,分别与溴化钾粉末混合,放入研钵内充分研磨,再采用压片法制得样品薄片。将样品薄片放入仪器内进行光谱扫描,扫描范围4 000~400 cm-1,分辨率4 cm-1,扫描次数32 次。以纯溴化钾粉末作背景进行单通道扫描。

1.3.6.4 分子对接法
采用1.3.1.1节的步骤,运用AutoDockTools 4.2软件对GLD与筛选出最适宜的CD包合模式进行模拟得到主客体间的构象及氢键相互作用。

1.3.7 GLD/CD固体包合物在模拟胃肠液中累积溶出率测定
按照Maltais等所述方法配制不含消化酶的模拟胃、肠液。准确称取2.0 g NaCl置于烧杯中,加入100 mL去离子水,用12.0 mol/L浓盐酸调节pH值至1.2,即为模拟胃液。准确称取6.8 g KH2PO4,溶于250 mL去离子水中,用0.2 mol/L NaOH溶液调节pH值至6.9,即为模拟肠液。分别量取900 mL模拟胃液和肠液作为溶出介质,放入1 000 mL烧杯中,置于水浴加热磁力搅拌器,温度保持在(37±0.5) ℃,转速50 r/min。分别准确称取一定质量的GLD、GLD/CD物理混合物及经不同制备方法得到的GLD/CD固体包合物样品(样品中GLD质量均为100 mg),放入烧杯中,并立即开始计时。于2、4、6、8、10、15、20、30、45、60 min时吸取溶出液1 mL,同时补充等体积新鲜的溶出介质。用0.45 μm微孔滤膜过滤溶出液,取滤液0.5 mL,加入4.5 mL乙腈,充分混匀。5 000 r/min离心5 min后,取上清液

㈧ 如何优化Chem 3D分子构型

1、MM2分子力学优构型优化方法

使用Chem 3D软件MM2分子力学优化构型的操作步骤是绘制出化学结构之后,依次选择Calculations/MM2/Minimize Energy(最小化化学能)命令,如下图所示:

MM2分子力学优构型优化方法

接着会弹出谨姿Minimize Energy对话框,“Display Every nth Iter用于显示每轮迭代信息”、“Copy Measurements to Output Bo用于控制输出每轮结构参数”、“Minimum RMS是构型收敛标准”。另外注意一下,MM2分子力学方法计算量小,适合于大体系有机分子的构型优化。

2、Gamess量子化学软件包构型优化方法

Gamess量子化学软件包进行构型优化的原理是Chem 3D根据初始分子模型计算能量和梯度,然后决定写一部结构调整的方向的步长,根据各原子受力情况滑庆和位移大小判断是否收敛,若没有则继续重复上面的过程直到力和位移的变化均达到收敛标准。在Chem 3D软件中的操作方法是:绘制出分子结构之后,依次点击Calculations/GAMESS Interface/Minimize,随后会弹出如下图所示的GAMESS对话框。

Gamess量子化学软件包构型优化方法

对话框Job&Thery选项卡的Method选项可以更改计算方法,Basis Set是基组类型,Wave Function是波函数类型,通过Polarization、Diffuse和Exponent可以添加或弥散基函数,Opt.Algorithm用于修改构型优化方法,最后的两个选项Spin Multiplicity和Net Charge指的是体系电荷和自选多重度。在Advanced-1选项卡中,绘制者可以更改自洽场迭代参数控制、溶剂祥让绝效应及其模型、MO初始猜测类型、点群及其主轴。GAMESS Interface所计算性质包括:偶极矩、电子密度、静电势、动能、Lowdin电荷和布居数、Mulliken电荷和布居数、势能和总能量。

㈨ 硼氢化钠的四个氢都有还原性吗

硼氢化钠
无机化合物
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审阅专家 包申旭
硼氢化钠(Sodium borohydride),是一种无机化合物,化学式为NaBH4,白色至灰白色结晶性粉末,吸湿性强,其碱性溶液呈棕黄色,是最常用的还原剂之一。溶于水、液氨、胺类,易溶于甲醇,微溶于乙醇、四氢呋喃,不溶于乙醚、苯、烃。在干空气中稳定,在湿空气中分解,500℃加热下也分解。通常情况下,硼氢化钠无法还原酯,酰胺,羧酸及腈类化合物,但当酯的羰基α位有杂原子存在时例外,可以将酯还原。通常用作醛类、酮类、酰氯类的还原剂,塑料工业的发泡剂,造纸漂白剂,以及医药工业制造双氢链霉素的氢化剂。
被列入《易制爆危险化学品名录》[8],并按照《易制爆危险化学品治安管理办法》管控[9] 。
中文名
硼氢化钠
外文名
Sodium borohydride
别名
四氢硼酸钠
化学式
NaBH4
分子量
37.83[2]
相关视频
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nabh4:硼氢化钠还原法制备催化剂
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研究简史分子结构理化性质计算化学数据应用领域相关危害应急处理安全信息TA说
研究简史
硼氢化钠是由H·C·Brown和其导师Schlesinger于1942年在芝加哥大学发现的。起初为了研究硼烷和一氧化碳络合物的性质,但意外却发现了硼烷对有机羰基化合物的有还原能力。由于当时硼烷属于稀有物质,因此并没有引起有机化学家的重视。硼烷化学的发展得益于第二次世界大战,当时美国国防部需要寻找一种分子量尽量小的挥发性铀化合物用于裂变材料铀235的富集。歼锋硼氢化铀U(BH4)4符合这个要求。该化合物的合成需要用到氢化锂,然改哪而氢化锂的供应很少,于是便宜的氢化钠便被用来作原料,而硼氢化钠就在这个过程中被发现。后来,因为六氟化铀的处理工艺问题得到解决,美国国防部便放弃了通过硼氢化铀来富集铀235的计划,而Brown的研究课题就变成了如何方便地制备硼氢化钠。Army Signal Corps公司对这个新化合物可以制备大量氢气的用途产生了兴趣。在他们的资助下,开展了相关的工业化研究。用醚类溶剂重结晶得到纯品硼氢化钠。[3]
硼氢化钠:3D结构式
分子结构
硼氢化钠有α、β、γ三种晶型。室温下是α型的NaCl结构立方晶体;6.3GPa下转变为β型四方晶体,8.9GPa下转变为γ型正交型晶体。 [7]
理化性质
物理性质
白色结晶粉末,吸湿性强,容易吸水潮解。溶于水、液氨、胺类。易溶于甲醇,微溶于乙醇、四氢呋喃。不溶于乙醚、苯、烃类。在干空气中稳定,在湿空气中分解,加热至500℃也分解。[1]
化学性质
1、由于硼氢化钠中的氢带有部分负电荷(B的电负性比H小),醇和胺类物质中-OH、-NH-、-NH2中的氢都带有较多的部分正电荷,所以硼氢化钠中的BH4-能与构成这些物质的分子之间形成双氢键,因此硼氢化钠能溶于水、液氨、醇和胺类物质。[1]
2、硼氢化钠会与水和醇等含有羟基的物质发生较缓慢的反应释放出氢气,同时因为反应较缓慢,短时间内硼氢化钠的损失量很少,因此硼氢化钠可以用碱性溶液、甲醇、乙醇作为溶剂。[1]
NaBH4+2H2O=NaBO2+4H2↑
NaBH4+4HO-R→B(OR)3 +4H2↑+NaOR
3、硼氢化钠是一种它具有较强选择还原性的无机化合物。在无机合成和有机合成中常用做还原剂[4],有良好的化学选择性。它可以在非常温和的条件下实现醛酮羰基的还原,生成一级醇、二级醇。少量硼氢化钠可以将腈还原成醛,过量则还原成胺。它能够将羰基、醛基选择还原成羟基,也可以将羧基还原为醛基,而不与酯、酰胺作用,一般也不与碳碳双键、三键发生反应。
4、硼氢化钠对醛、酮的还原效果比较好。常用溶剂是醇,四氢呋喃,二甲基甲酰胺(DMF),水等。它一般不还原酯基,酰胺,但在高浓度,高温,核改码配合合适溶剂或用路易斯酸催化时,可以还原酯基等比较弱的羰基。
5、硼氢化钠在酸性条件下会快速分解产生氢气,是不能稳定存在的,但可以在中性或碱性条件下稳定存在,且pH=14时最稳定。
NaBH4+H++3H2O=H3BO3+Na++4H2↑[5]
6、硼氢化钠不能单独还原羧酸,必须与碘联合使用,先与羧酸反应至气泡停止后就加入碘,继续放气体。随后加入盐酸分解形成的硼酸酯,就可以获得醇。[3]
7、用硼氢化钠与无水氯化锌(200℃以上脱水干燥)在无水四氢呋喃(THF)中反应3小时后,可以制得硼氢化锌,该溶液混合物不需要进行分离纯化,就可以当作硼氢化锌使用。
计算化学数据
疏水参数计算参考值(XlogP):0
氢键供体数量:0
氢键受体数量:1
可旋转化学键数量:0
互变异构体数量:0
拓扑分子极性表面积:0
重原子数量:2
表面电荷:0
复杂度:2
同位素原子数量:0
确定原子立构中心数量:0
不确定原子立构中心数量:0
确定化学键立构中心数量:0
不确定化学键立构中心数量:0
共价键单元数量:2
应用领域
硼氢化钠可用作醛类、酮类和酰氯类的还原剂,制造硼氢化钾的中间体,制造乙硼烷和其他高能燃料的原料,用作塑料工业的发泡剂,造纸工业含汞污水的处理剂、造纸漂白剂,以及医药工业制造双氢链霉素的氢化剂。硼氢化钠的氢在这里显-1价,有很强还原性,可以还原有一定氧化性的无机物,它主要用于有机合成中的-COOH还原成-CH2OH,被成为“万能还原剂”。它的性能稳定,还原时有选择性。硼氢化钠给有机化学家们提供了一种非常便利温和的还原醛酮类物质的手段。在此之前,通常要用金属/醇的办法来还原羰基化合物,而硼氢化钠可以在非常温和的条件下实现醛酮羰基的还原,生成一级醇和二级醇。硼氢化钠作为还原剂可以用于有色金属化学镀,其中最主要应用于化学镀镍。化学镀镍最常用的还原剂是次磷酸钠,使用该种还原剂所镀的镍主要为镍磷合金。而使用硼氢化钠作为还原剂则是得到镍硼合金,但是硼在镀层中的含量远小于另一种还原剂所的镀层的磷含量。在化学镀中,理论上单位物质的量的硼氢化钠可以还原的镍是次磷酸钠的四倍,添加量远少于次磷酸钠。但硼氢化钠容易分解,需要保持镀液pH在12以上,否则会使镀液失效,硼氢化钠的氧化产物偏硼酸钠的累积也会对镀液产生不良影响。[6]
相关危害
毒理学数据
急性毒性:大鼠口经LD50:18 mg/kg(大鼠腔膜内)[2]
主要的刺激性影响:
在皮肤上面和粘膜上造成腐蚀性影响,在眼睛上面有强烈的腐蚀性影响,没有已知的敏化影响。[2]
危险特性:遇水、潮湿空气、酸类、氧化剂、高热及明火能引起燃烧。[2]
燃烧(分解)产物:氧化硼、氢气。[2]
健康危害
侵入途径:吸入、食入、经皮吸收。
危害:本品强烈刺激粘膜、上呼吸道、眼睛及皮肤。吸入后,可因喉和支气管的痉挛、炎症和水肿,化学性肺炎和肺水肿而致死。口服腐蚀消化道。与硼氢化钠接触后有咽喉痛,咳嗽,呼吸急促,头痛,腹痛,腹泻,眩晕,眼结膜充血,疼痛等症状。应防止粉尘飞扬,加强通风或戴防护面具,注意对眼睛的保护,戴密闭式防护眼镜,不准在工作时进食、喝水及吸烟。中毒后迅速离开现场,半卧位休息,吸入新鲜空气,用大量水冲洗眼睛,脱去被沾染衣服,淋洗全身。进入消化道者,立即漱口,大量饮水催吐,随即送医院治疗。泄漏时戴过滤式防护面具仔细清扫漏物。[2]
应急处理
泄漏应急处理
隔离泄漏污染区,周围设警告标志,切断火源。建议应急处理人员戴好防毒面具,穿化学防护服。 不要直接接触泄漏物,禁止向泄漏物直接喷水,更不要让水进入包装容器内。用清洁的铲子收集于干燥净洁有盖的容器中,转移至安全地带。如果大量泄漏,收集回收或无害处理后废弃。[2]
防护措施
呼吸系统防护:作业工人应该佩带防尘口罩。必要时建议佩带自给式呼吸器。
眼睛防护:戴化学安全防护眼镜。
身体防护:穿相应的防护服。
手防护:戴防护手套。[2]
急救措施
皮肤接触:脱去污染的衣着,立即用流动清水彻底冲洗。
眼睛接触:立即提起眼睑,用流动清水或生理盐水冲洗至少15分钟。
吸入:脱离现场至空气新鲜处。保持呼吸道通畅。必要时进行人工呼吸。就医。
食入:误服者立即漱口,给饮牛奶或蛋清。就医。[1]
安全信息
安全术语
S22:Do not breathe st.
切勿吸入粉尘。
S26 :In case of contact with eyes, rinse immediately with plenty of water and seek medical advice.
不慎与眼睛接触后,请立即用大量清水冲洗并征求医生意见。
S36/37/39:Wear suitable protective clothing, gloves and eye/face protection.
穿戴适当的防护服、手套和护目镜或面具。
S45:In case of accident or if you feel unwell, seek medical advice immediately (show the label whenever possible.
若发生事故或感不适,立即就医(可能的话,出示其标签)。
风险术语
R15:Contact with water liberates extremely flammable gases.
遇水释放极易燃烧的气体。
R22:Harmful if swallowed.
吞食有害。
R23/24/25:Toxic by inhalation, in contact with skin and if swallowed.
吸入、皮肤接触及吞食有毒。
R34:Causes burns.
引起灼伤。
R43:May cause sensitization by skin contact.
与皮肤接触可能致敏。
R53:May cause long-term adverse effects in the aquatic environment.
可能对水体环境产生长期不良影响。
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参考资料
[1] 化学工业部天津化工研究院等. 化工产品手册 无机化工产品[M].化学工业部天津化工研究院.1982 :43-48
[2] 海关总署关税征管司编着.危险化学品归类指南 下[M].海关总署关税征管司.2017:831-834
[3] 郑学家. 硼化合物生产与应用[M]. 化学工业出版社, 2008..网络学术 [引用日期2020-03-14]
[4] 白银娟,路军,马怀让. 硼氢化钠在有机合成中的研究进展[J]. 应用化学(5):409-415..网络学术 [引用日期2020-03-14]
[5] 徐东彦, 张华民, 叶威. 硼氢化钠水解制氢%Hydrogen Proction from Sodium Borohydride[J]. 化学进展, 2007, 019(010):1598-1605..网络学术 [引用日期2020-03-14]
[6] 李宁.化学镀实用技术[M].北京:化学工业出版社,2004:308-317.网络学术 [引用日期2020-03-14]
[7] 周公度.化学辞典(第二版).化学工业出版社.2010
[8] 公安部公布2017年版易制爆危险化学品名录.中华人民共和国中央人民政府 [引用日期2021-11-29]
[9] 《易制爆危险化学品治安管理办法》(公安部令第154号).中华人民共和国公安部 [引用日期2021-11-29]
[10] Sodium borohydride.PubChem [引用日期2022-05-25]

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