omim数据库怎么用

‘壹’ 如何在NCBI上查到某个给定基因的序列，并且在序列中清楚的显示出其中的外显子和内含子

1、首先输入基因的完整学名，找到与基因相关的cDNA序列。在这一cRNA序列的解说信息里，就已经有各外显子的分节。
2、将该cDNA输入Blast进行序列比对，就可以找到其每一个外显子所对应的染色体位置，这些信息就显示了所有的外显子。处于外显子两端的序列就是内含子。
3、如你需要完整的基因序列，需要在blast中选择others这个数据库，然后查找相关的Bac质粒中含有你完整基因的文件，在其中找到你所需的信息。

‘贰’ 如何使用 omim 数据库资源

OMIM数据库之父Victor Almon McKusick先生是位临床医生。该数据库的最原始的版本是一本叫MIM的遗传学书籍，后来挪到了网上，就加了一个“O”称为在线的人类孟德尔遗传学。所以OMIM数据库不同于其他的NCBI数据库。其设计之初是为临床医生提供在线浏览的服务，因此没有相应的序列下载服务。从另外一个角度来说，OMIM的每一条记录讨论的是某一个基因，而与这个基因相关的序列可能有几条，几十条甚至上百条的记录。

要解决你的问题，如果数量不多，例如50以内。建议你手工通过OMIM提供的RefSeq的链接获取。这个方法的优点是，你可以挑选你想要的序列（mRNA， DNA或Protein），消耗的时间上与编程差不多。

如果超过100，或需要反复做，就有编程的必要。你可以参考我提供的链接使用eUtils工具来获取序列。

‘叁’ OMIM的gene map怎么看

把目标OMIM基因序列下载下来，点击页面工具栏的View-DNA-getDNA，输入所需下载OMIM基因所在的染色体位置，点击“getDNA”。
OMIM为“”的简称，意即“在线《人类孟德尔遗传》”或“网上《人类孟德尔遗传》”。持续更新的关于人类基因和遗传紊乱的数据库。主要着眼于可遗传的或遗传性的基因疾病，包括文本信息和相关参考信息、序列纪录、图谱和相关其他数据库。

‘肆’ 同时存在一个omim是什么意思

OMIM 数据库：可查询任何遗传病、性状或基因的资料；这是已经在数据库，有资料吗？

‘伍’ 在NCBI上怎么找到一个基因的外显子和内含子

事实上，在NCBI有很多种办法可以确定某个基因的外显子或者内含子，当然还有UTR区域。今天我们来介绍NCBI的其中一个使用软件Splign来在NCBI上找到一个基因的外显子和内含子。操作步骤如下：

1.在Gene数据库，填入基因名HNF-4，我一般的话习惯叫Symbol，每个基因都有个Symbol，即基因名。

‘陆’ 如何利用NCBI查询蛋白质等电点

NCBI无法查询蛋白质等电点，可以到swissprot查询。

这个NCBI没有相关的功能，这个是以核苷酸序列为主。因为等电点特性是蛋白质水平的分子特性，可以到swissprot进行查询，查询蛋白质等电点需要到专业的平台进行查询。

另外NCBI开发有Genbank等公共数据库，提供Pubmed、BLAST、Entrez、OMIM、Taxonomy等工具，可对国际分子数据库和生物医学文献进行检索和分析。

(6)omim数据库怎么用扩展阅读：

NCBI开发用于分析基因组数据和传播生物医学信息的软件工具。NCBI支持与推广多种医学及科技方面的数据库，如：三维蛋白质结构的分子模型数据库（MMDB）、孟德尔人类遗传（OMIM）等。

另外使用CD-Search工具来可以鉴定蛋白质或者核酸序列内的保守结构域或功能单位。该工具位于NCBI中。可以进入NCBI后选择ConservedDomain中的Search。

除此之外这个网站Search的黄色部分其中CD-search只能提交单条序列，BatchCD-Search可以上传多条序列，里面收录的数据范围是比较广的，可以利用NCBI进行检索。

‘柒’ 如何用ensembl基因组数据库进行timetree

在NCBI上的OMIM数据库输入基因名，在TITLE上就会显示它的学名。

用学名检索基因是比较靠谱的。建议用ENSEMBL找基因，显示其外显子和内含子。进入ENSEMBL的方法有两种，1.NCBI上进入基因的检索条以后，summary里会有相应的ENSEMBL的链接（see related）；2.直接进入ENSEMBL主页检索该基因。进入基因的检索条以后，点左侧的CDNA和EXONS就能相应地看到转录本的注释信息，包括外显子和内含子的注释，5‘和3’UTR的注释，和密码子的注释。

‘捌’ 怎样在OMIM数据库中查找与某种疾病有关的基因急用，谢谢

你直接上OMIM搜索GBM就是，下面就出来了跟它相关的基因啊