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如何用数据库查某个物种的基因组

发布时间:2022-12-14 03:37:48

‘壹’ 请问怎么查一个生物的基因组的全序列

假如你要查蛋白质
例:1.网址中输入NCBI,点开NCBI主页。
2.在主页的右上方有可选框,选择protein,后面输入蛋白名称,如果想具体找到的话,直接输入物种加蛋白,回车即可。

‘贰’ 怎样在NCBI中查找一物种的全基因组

直接用关键词Homosapiensmitochondrion在genome数据库中搜索就行了。找completegenome

‘叁’ 如何查基因组

很多物种都有其单独的基因组数据库网站,如斑马鱼。你可以google下,如zebrafish genome database,可以找到ZFIN
还有,一般NCBI里面会收录已经测序的基因组

‘肆’ 怎么查找一个蛋白质的基因组序列

网址中输入NCBI,点开NCBI主页。。在主页的右上方有可选框,选择protein,后面输入蛋白名称,如果想具体找到的话,直接输入物种加蛋白,回车即可。

1、打开NCBI主页。

2、左边search里面选择GENE 右边的对话框里输入你想要的基因名称。

3、 在出来的所有条目第一行后面都有种属表明,比如Homo sapiens是人Felis catus是猫。选择你想要的种属。

4、再出现的页面中找到那个像数轴的图,在左侧有可以点击的蓝色数字,往往开头有AK、NM的开头,点击它,再出现的下拉框里选择GENEBANK。

5、最下面就是他的基因序列 当然也可以参考页面上提供的CDS区域范围来看。



注意事项

NCBI (National Center for Biotechnology Information)是指美国国立生物技术信息中心。理解自然无声但精妙的关于生命细胞的语言是现代分子生物学的要求。通过只有四个字母来代表DNA化学亚基的字母表,出现了生命过程的语法,其最复杂形式就是人类。

阐明和使用这些字母来组成新的“单词和短语”是分子生物学领域的中心焦点。数目巨大的分子数据和这些数据的隐秘而精细的模式使得计算机化的数据库和分析方法成为绝对的必须。

‘伍’ 求助,如何查找细菌的全基因组序列

可以在NCBI,genome数据库。
从genome数据库里找的话就比较麻烦,想用RACE,3'末端需要添加像真核物polyA尾巴,且要克隆全基序列,要做5'RACE.
RACE技术比较适合真核物.
要克隆基保守,genbank查找些与菌亲缘关系比较近菌种,看基已经提交,全基组更,通设计同源引物,便基克隆.原核物基含内含,所基组扩增,原核物mRNA稳定.
7氨基酸序列用NCBI比找同源序列比较困难.缩范围做比,比Burkholderia基或蛋白做比(参数选择Choose Search SetOrganism限定物种).另外,用blastp找同源序列,妨用tblastnBurkholderia基组或者所细菌核酸序列比看看
.NCBI种Burkholderiagenome序列.外,关于Burkholderia脂肪酶基序列,设定关键词查,蛋白序列都载做序列比较,至少同源性,及氨基酸序列跟同源性定启示.

‘陆’ 如何通过生物信息数据库分析某一物种的基因和蛋白质信息,包括基因组DNA;基因结构;mRNA;蛋白质的1-4级

问题不是很明确,是想进行序列比对与结构比对吗?序列比对用NCBI网站中的Blast就可以分别进行核酸与蛋白的比对,蛋白结构比对,如果没有晶体结构,就需要先同源建模,再进行结构拟合就可以了!希望能帮到你,有问题欢迎追问!

‘柒’ 怎样在NCBI中查找一物种的全基因组

打开后在Search中选择Nucleotide再在下面输入FRAT1点击Search即可也可输入具体的物种名以缩小范围.

‘捌’ 如何用NCBI数据库查病毒全基因的背景信息

选择NCBI genome数据库,这个库中收录目前经过测序的所有物种的参考基因组。你只要输入你需要的病毒名称比如HIV,就可以看到这个病毒的全基因组序列。你还可以点击某条序列,进入到详细信息界面,就可以看到这个序列的来源。

‘玖’ 如何从基因组数据中查找基因家族

NCBI中的gene数据库,然后把你的基因名称输入,并选择相应的种属,点击相应的基因后,你就会看到这个基因的所有isoform。如果不清楚的话,可以直接联系我
fanby (站内联系TA)
2楼: Originally posted by xxj0214246 at 2013-02-11 13:21:08
NCBI中的gene数据库,然后把你的基因名称输入,并选择相应的种属,点击相应的基因后,你就会看到这个基因的所有isoform。如果不清楚的话,可以直接联系我
该基因在研究的物种中的cDNA序列未知。我想咨询的问题是,基于已经分离该基因的一个cDNA序列,通过何种实验方法可以分离到其他成员的序列?谢谢!

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