① R语言内置mtcars数据集的小问题,求代码
rownames(mtcars)[which(mtcars['qsec']==min(mtcars['qsec']))]
mtcars['disp'][mtcars['qsec']==min(mtcars['qsec'])]
mean(mtcars['mpg'][mtcars['cyl']==4])
② 如何用R语言在数据中提取指定列数据,并且形成一个新的数据表
最简单的方法,数据框的名称,加上你要提取的列数,示例如下:
需要注意的是,如果只提取单列的话,得到的数据就变成了一个vector,而不再是dataframe的格式了。
③ 如何使用R中内置的数据集
dim(data()$results )
data()$results [ ,4]
R 在 datasets 包提供了 100 个可以使用的数据集,这些数据集都可以通过 data() 函数加载入内存
④ R语言自学笔记-3设置路径、R包操作
#设置默认路径
#显示当前工作目录(软件默认使用工作目录)
getwd()
#修改默认工作目录
setwd(dir = "e:/Rwork/")
#提示工作目录
getwd()
#查看目录下包含的文件
list.files()
#或者
dir()
#R包安装
install.packages("vcd")
#显示库所在的位置
.libPaths()
#显示库里有哪些安装包
library()
#载入包
library(vcd)
#or
require(vcd)
#直接输入函数看某些函数来自于R的哪个包
#如何使用R包
help(package="vcd")
help(package="ggplot2")
#查看包的信息,列出R包的基础内容,显示内置的数据集的内容,给包中的函数作为案例来使用
library(help="vcd")
#还有一些包中的函数,是包的核心内容,扩展了R的功能
Arthritis
#列出包中所有包含的函数
ls("package:vcd")
#每个函数如何使用查看对应帮助文档
#列出R包中包含的所有数据集
data(package="vcd")
#使用完一个包之后,将包从内存中移除
detach("package:vcd")
#再使用
Arthritis
#会出现报错:需要重新再加载
#删除已安装的包
remove.packages("vcd")
#会将R包从硬盘上彻底删除,无法继续使用了,用得不多
#R包的批量移植(更换新设备)
#列出当前环境中已安装的R包
installed.packages()
#取第一列,,,使用下标来访问数据框的第一列
installed.packages()[,1]
#将所以R包名字保存到一个文件中
Rpack<- installed.packages()[,1]
save(Rpack,file = "Rpack.Rwork")
#将这个文件移到另一个设备上
#在另一个设备上使用load函数打开这个文件
#存到另外一个变量Rpack中
#看到这些R包
#Rpack
#批量安装这些R包
#使用一个for循环
for(i in Rpack)install.packages(i)
#如何获取R的帮助信息
help.start()
#查看某个函数的功能
help(sum)
#or
?plot
?sum
#快速了解函数参数而不想查阅详细文档
args(plot)
#查看函数使用案例
example(mean)
example("hist")
#列出R的一些案例图
demo(graphics)
#查看R安装的某个包的帮助文档
help(package=ggplot2)
#有些R包包含vignette文档,这中文档包含更多内容,也更加规范,里面有简介、教程、开发文档等
vignette()
#不是每个包都包含这种格式的文档
vignette("xts")
#有时安装了某包但使用help命令搜索不到相关函数,是因为没有载入这个包
#需用使用library函数载入这个包
#载入之后才能使用help函数找到相关文档
#或者直接在help命令中加上package选项 等于 要搜索R包的名字,这种方法比较麻烦
#??接要搜索函数名字,这种情况下不加载包也可以
#有些情况下,不知道具体的函数名,只能模糊搜索
#查找与绘制热图相关的帮助信息(使用这条命令进行本地搜索)
help.search(heatmap)
#提示搜索不到
#因为需要加上引号
help.search("heatmap")
#搜到stats包中的heatmap函数,可以用来绘制热图
#help.search("heatmap")也可以简写成下面一条命令
??heatmap#不需要加引号
#列出所有包含关键字的内容
apropos("sum")
#可以通过mod参数调整查询的内容
apropos("sum",mod="function")#只列出函数
#help.search或??都是进行本地的文档搜索
#有时搜索不到或者文档太老了可以使用RSiteSearch()函数进行网络搜索
RSiteSearch(matlab)
#运行函数会使用默认浏览器来访问R官网,在官网中进行搜索,列出更多的结果
#可以利用搜索引擎进行问题搜索
⑤ R语言之创建数据集
R语言之创建数据集
数据集通常是由数据构成的一个矩形数组,行表示观测,列表示变量。
R中有许多用于存储数据的结构,包括标量、向量、数组、数据框和列表。
在R中,对象(object)是指可以赋值给变量的任何事物,包括常量、数据结构、函数、甚至是图形。因子(factor)是名义型变量或有序型变量,在R中被特殊地存储和处理。
R中的数据结构:
1.1向量
向量是用于存储数值型、字符型或逻辑型数据的一维数组。创建向量使用函数c(),如下例所示:
数值型向量:a<-c(1,2,5,3,6,-2,4)
字符型向量:b<-c("one","two","three")
逻辑型向量:c<-c(TRUE,TRUE,TRUE,FALSE,TRUE)
注:单个向量中的数据必须拥有相同的类型或模式。
标量是只含一个元素的向量,例如f<-3、g<-"US"和h<-TRUE。它们用于保存常量。
访问向量中的元素,可在方括号中给定元素所处位置的数值,如:a[c(2,4)]用于访问向量a中的第二个和第四个元 素。
1.2矩阵
矩阵是一个二维数组,只是每个元素都拥有相同的模式(数值型、字符型或逻辑型),可以通过matrix创建矩阵
一般使用格式为:
mymatrix<-matrix(vector,nrow=number_of_rows,ncol=number_of_columns,byrow=logical_value,dimnames=list(
char_vector_rownames,char_vector_colnames)) ,其中vector包含了矩阵的元素,nrow和ncol用以指定
行和列的维数,dimnames包含了可选的以字符型向量表示的行名和列名。选项byrow则表明矩阵应当按行
填充(byrow=TRUE)还是按列填充(byrow=FALSE),默认情况下按列填充。代码演示如下:
[plain] view plain
> cells<-c(1,23,56,485)
> rnames<-c("R1","R2")
> cnames<-c("c1","c2")
[plain] view plain
<pre name="code" class="html">> mymatrix<-matrix(cells ,nrow=2,ncol=2,byrow=TRUE,dimnames=list(rnames,cnames))
> mymatrix
c1 c2
R1 1 23
R2 56 485
1.3数组
数组与矩阵类似,但是维数可以大于2。数组可通过array函数创建,形式如下:
myarray<-array(vector,dimensions,dimnames),其中vector包含了数组中的数据,dimensions是一个数值型向量,给出了各个维度下标的最大值,而dimnames是可选的、各维度名称标签的列表。代码如下:
[html] view plain
> dim<-c("A1","A2")
> dim1<-c("A1","A2")
> dim2<-c("B1","B2","B3")
> dim3<-c("C1","C2","C3","C4")
> z<-array(1:24,c(2,3,4),dimnames=list(dim1,dim2,dim3))
> z
, , C1
B1 B2 B3
A1 1 3 5
A2 2 4 6
, , C2
B1 B2 B3
A1 7 9 11
A2 8 10 12
, , C3
B1 B2 B3
A1 13 15 17
A2 14 16 18
, , C4
B1 B2 B3
A1 19 21 23
A2 20 22 24
1.4数据框
数据框中不同的列可以包含不同模式(数值型、字符型等)的数据,是R中最常处理的数据结构。数据框可以通过函数data.frame()创建:mydata<-data.frame(col1,col2,col3,...),其中的列向量col1,col2,col3,...可为任何类型(如字符型、数值型或逻辑型)。每一列的名称可由函数names指定。代码如下:
[html] view plain
> age<-c(25,34,28,53)
> patientID<-c(1,2,3,4)
> diabetes<-c("Type1","Type2","Type1","Type1")
> status<-c("Poor","Improved","Excellent","Poor")
> patientdata<-data.frame(patientID,age,diabetes,status)
> patientdata
patientID age diabetes status
1 1 25 Type1 Poor
2 2 34 Type2 Improved
3 3 28 Type1 Excellent
4 4 53 Type1 Poor
> patientdata$age
[1] 25 34 28 53
<pre name="code" class="html">> table(patientdata$diabetes,patientdata$status)
Excellent Improved Poor
Type1 1 0 2
Type2 0 1 0
$被用来选取一个给定数据框中的某个特定变量,上面table(patientdata$diabetes,patientdata$status)生成了 diabetes和status的列联表。
函数attach()可将数据框添加到R的搜索路径中。
函数detach()将数据框从搜素路径中移除。
相对于attach。多数的R书籍更推荐使用函数with()。
1.5因子
变量可归结为名义型、有序型或连续型变量。类别(名义型)变量和有序类别(有序型)变量在R中称为因子。因子在R中非常重要,因为它决定了数据的分析方式以及如何进行视觉呈现。
函数factor()以一个整数向量的形式存储类别值,整数的取值范围是[1...k](其中k是名义变量中唯一值得个数),同时一个由字符串(原始值)组成的内部向量将映射到这些整数上。
名义型eg:假设有向量:diabetes<-c("Type1","Type2","Type1","Type1")
语句diabetes<-factor(diabetes)将此向量存储为(1,2,1,1).
有序型eg: 对于给定变量status<-c("Poor","Improved","Excellent","Poor")
语句status<-factor(status,ordered=TRUE)会将向量编码为(3,2,1,3)。
1.6列表(list)
列表是R的数据类型中最为复杂的一种。列表就是一些对象的(或成分,component)的有序集合。列表允许你整合若干(可能无关)的对象到单个对象名下。例如,某个列表中可能是若干向量、矩阵、数据框,甚至是其他列表的组合。可以使用函数list()创建列表:
mylist<-list(object1,object2,...)
注:列表成为了R中的重要数据结构。
1.列表允许以一种简单的方式组织和重新调用不相干的信息;
2.许多R函数的运行结果都是以列表的形式返回的。
⑥ R中选择数据框的列
在本教程中,您将学习如何使用R函数select()和pull()[在dplyr包中]按名称和位置选择数据框的列。我们还将展示如何从数据框架中删除列。
包含以下函数:
pull (): 以向量的形式提取列值. 可以通过名称或索引指定感兴趣的列。
select ():将一个或多个列提取为一个数据表。它还可以用于从数据框架中删除列。
select_if (): 根据特定条件选择列。例如,可以使用这个函数来选择列(如果它们是数值型的)。
帮助函数 - starts_with (), ends_with (), contains (), matches (), one_of (): Select columns/variables based on their names
需要的包
加载 tidyverse 包,该R包中包含 dplyr 包:
示例数据
我们将使用R内置的iris数据集,首先将其转换为tibble数据框(tbl_df),以便于进行数据分析。
以向量vector 的形式提取列值
将列提取为数据表
1)按位置选择列
按名称选择列
有几个特殊的函数可以在 select() 函数里面使用 starts_with (), ends_with (), contains (), matches (), one_of (), 等.
基于一个条件选择列
可以对列应用一个函数。选择函数返回TRUE的列。
只选择数值型的列:
删除列
若要从数据框架中删除列,请在其名称前加上一个减号 - .
注意,如果希望按位置放置列,语法如下所示。
在本教程中,我们介绍如何根据位置和名称选择列。此外,我们还介绍了如何从数据框架中删除列。
⑦ 怎么才能查看R语言某个包某函数源码
如果是程序包中自己带的函数,可用以下操作:
https://cran.r-project.org/
点击左侧Packages
点击中间Table of available packages, sorted by date of publication链接,进入包的列表界面
ctrl+F组合键在网页中搜索你关心的R包,例如包WGCNA,点击进入此R包主界面
点击Downloads下面的Packagesource:
WGCNA_1.51.tar.gz
解压此包,然后找到里面名字为R的文件夹,里面都是R语言包中包含的R的函数的代码
如果是在bioconctor中的包,可以在bioconctor官网中搜索此R包,进入此包界面,下载.tar.gz的这个文件,寻找方法如上.
⑧ r语言如何建立数据集
一般都是写在Excel中,然后导入R语言。导入代码如下:
install.packages('xslx')
library(xlsx)
Sys.setlocale("LC_ALL", "zh_cn.utf-8")
a=read.xlsx2('d:/1.xlsx',1,header=F)
head(a)显示前六行
class(a$y)/str(a)查看列/全集数据类型
a$y=as.numeric(a$y)转换数据类型
⑨ 【2020-05-31】如何查看并使用R的内置数据集
1、查看
R的内置数据集一共有两种:R内部 datasets 包中的数据集以及安装的其他 package 中包含的数据集,这些数据集的查看方法如下:
2、使用