㈠ 細胞純化分離—密度梯度篇
細胞純化分離技術中，密度梯度法佔據重要地位。單細胞測序因其能揭示混雜樣品中隱藏的異質性信息而備受關注，這有助於研究細胞發育和調控機制。關鍵步驟是獲得高純度和完整細胞（核）懸液，這對於後續生信分析至關重要。密度梯度離心技術利用粒子在不同密度介質中的遷移速度進行分離，如蔗糖、Ficoll、Percoll和OptiPrep等。
蔗糖具有高滲透壓，常用於細胞器、病毒和RNA分離，但不適於細胞分離；Ficoll適合分離特定密度的細胞，如從血液中分離淋巴細胞和單核細胞；Percoll的低粘度和穩定性使其適用於多種生物顆粒的純化，如植物原生質體和葉綠體；OptiPrep則因其親水性和高密度，廣泛用於分離細胞、病毒和蛋白質等。
這些介質各有特點，例如Ficoll根據細胞密度的不同進行分離，而Percoll的顆粒大小異質性使其形成均勻梯度；OptiPrep的碘克沙醇濃度梯度能有效純化不同類型的細胞。例如，Takamatsu等人優化了水稻葉綠體DNA提取，Gan等人使用Ficoll分離皮毛囊毛囊間充質幹細胞，Bhattacharya等人則介紹了一種番茄葉綠體提取方法，而Kovacovicova等人則通過OptiPrep分離衰老細胞。每種方法都有其特定的應用范圍和優化的實驗步驟，以確保實驗結果的高質量。