『壹』 16SrDNA的16S rRNA
原核生物的rRNA含有3種類型:23S、16S、5SrRNA,它們分別含有2,900、1540和120個核苷酸,23S核苷酸含量過多,幾乎是16S核苷酸含量的兩倍,分析困難;而5S核苷酸又太少,沒有足夠的遺傳信息,只有16S長度適中信息量較大且易分析。
在細菌的16SrDNA中有多個區段保守性,根據這些保守區可以設計出細菌通用物,可以擴增出所有細菌的16SrDNA片段,並且這些引物僅對細菌是特異性的,也就是說這些引物不會與非細菌的DNA互補,而細菌的16SrDNA可變區的差異可以用來區分不同的菌。因此,16SrDNA可以作為細菌群落結構分析最常用的系統進化標記分子。隨著核酸測序技術的發展,越來越多的微生物的16SrDNA序列被測定並收入國際基因資料庫中,這樣用16SrDNA作目的序列進行微生物群落結構分析更為快捷方便。
『貳』 目前什麼資料庫最好用啊!
當今主流地資料庫:SQL Serve、Oracle、IBM DB2
SQL Serve是Microsoft(微軟)地資料庫產品,Microsoft SQL Serve脫胎於Sybase SQL Serve。
Microsoft的SQL Serve針對不同用戶群體的多個版本,易用性好。
企業版(SQL Serve 2005 Enterprise Edition)
最全面的版本,支持所有的SQL Serve 2005提供的功能。
標准版(SQL Serve 2005 Standard Edition)
適合於中小型的需求。
工作組版(SQL Serve 2005 Workgroup Edition)
入門資料庫最好的選擇
開發版(SQL Serve 2005 Enterprise Edition)
覆蓋了標准版的功能,且能夠生產應用程序,不允許作為生產系統。
評估版(SQL Serve 2005 Enterprise Edition)
有180天使用時間限制。
Oracle是Oracle(甲骨文)公司的資料庫產品,Oracle資料庫系統號稱世界上最好地資料庫系統,有很長地歷史。Oracle成立於1977年,最初就是專門地資料庫公司。
Oracle8加入了對象技術成為「關系-對象」型資料庫系統。它地產品免費、服務收費。
Oracle資料庫能適應70多種操作系統。
Oracle資料庫成為世界上使用最廣泛的資料庫系統。
DB2是IBM 公司的產品,支持多操作系統、多種類型的硬體和設備。
這回知道了吧
『叄』 高通量測序16srrna基因序列用什麼基因資料庫比對比較好
silva最好,其次greengene(很久沒更新了),rdp官網也提供資料庫;還有ncbi 提供了人工矯正過的16s database。
『肆』 現在最好的資料庫是那個資料庫
最好學的一定不是最好的資料庫。
最好的資料庫不是最好用的資料庫。
最好學的也不見得就是最好用的資料庫。
Oracle和DB2算是目前商業應用最多的大型資料庫。學好這個比較有前途和錢途。
SqlServer在中低端是一枝獨秀。應用太大的情況下就會死的很慘,也算最好學的,畢竟學習資源較多,幫助也簡便易用。
mysql是很好用的資料庫,因為免費使用也不涉及版權問題。
sybase與informix雖然也都不錯,可高一點搞不過oracle,低一點干不過sqlserver。informix最慘,都被收購了這么多年,它後續的支持和發展的情況大家都清楚。可憐啊,其實informix真的是很好用的資料庫,雖然N次崩潰折騰過我無數通宵,長事務恨的我牙根癢癢
『伍』 將16s rRNA測序數據上傳NCBI的SRA資料庫,釋放數據的時間選擇最好是什麼時候
一般上傳數據到NCBI SRA的過程需要6步:
1、Create a BioProject for this research
2、Create a BioSample submission for your biological sample(s)
3、Gather Sequence Data Files
4、Enter Metadata on SRA website
a、Create SRA submission
b、Create Experiment(s) and link to BioProject and BioSample
c、Create Run(s)
5、Transfer Data files to SRA
6、Update Submission with PubMed links, Release Date, or Metadata Changes
需要注意的一點是,上傳的過程中很多地方一旦保存或提交就不可以修改,尤其是各處的Alias。但是,可以聯系NCBI的工作人員修改內容。NCBI的工作效率是很高的,一般不超過48小時,就可以得到確認,並拿到登錄號。
『陸』 現在什麼資料庫比較好用呀
小點的access、visual foxpro,大型的就多了,sql server、oracle、my sql這幾個比較常見,還有sybase、DB2等等。
『柒』 我想學資料庫 哪個資料庫更好呢Access還是SQL還是Oracle呢
對於初學者,我看還是sql吧。
其實你說sql,應該叫sqlserver吧,畢竟是windows上的,安裝配置使用都好弄。oracle就比較啰嗦了。
至於access,可以不用考慮。你看看sqlserver,access也就差不多了。語句差別不大。
SQL,是一種標准,各家公司都按照SQl的標准,開發了自己的資料庫產品。如Oracle公司的oracle,ms的sqlserver,Sybase公司的sybase,IBM的db2等等。所以以後不要說sql,要說sqlserver,因為oracle的語言也是sql.呵呵。
『捌』 學習資料庫,現在用什麼資料庫比較好
FOX的話個人感覺已經過時了~只在一些小系統什麼的用用吧
SQL SERVER的話微軟的產品,雖然微軟放出話來,資料庫方面要超越ORACLE
但是個人感覺他也就放放話了,還是看好ORACLE
關於ORACLE的學習,個人意見,僅供參考,本人也在學習中。
下面這些都是我個人總結的。希望對你有幫助。
首先需要了解下 數據模型 關系資料庫 DBMS 範式 自然運算 等等概念性的東西,可以去書店或者圖書館查閱相關書籍,可以了解下,沒必要完全掌握,當然你要能掌握的話,那麼對你的以後是非常有幫助的。
其實然後就是SQL標准 對象關系SQL 基本的SQL查詢,以及最基本的SELECT/UPDATE/INSERT/DELETE語法,各種不同的資料庫大同小異的。
然後就是不同的資料庫,不同的用法,你也可以專學一門,比如ORACLE
或者MSSQL MYSQL INFORMIX DB2主要這幾種~
這些入門了就可以學習嵌入資料庫了,訪問資料庫的程序
以及資料庫的性能優化,完整性,視圖,安全 目錄 備份 還原等等
當然主要學習ORACLE的話你也可以先直接挑本ORACLE入門看,類似ORACLE10G入門,ORACLE基礎的書,不求完全懂,能看一點是一點,學習ORACLE是一個長期的過程,你在懂了一些後,再去看別的書,你會找到很多相同點,那時候就會有恍然大悟的感覺,一點點看就OK了~
到了一定的程度,你就知道自己怎麼去學習,需要掌握些什麼,像什麼方向發展了。
另外在學習的過程中推薦有疑問的就自己做實驗操作,或者去各大論壇像CSDN,CNOUG,ITPUB,CNBLOGS查找答案或者提問,也可以下載裡面的基礎區的教程了,不過大多是達人們整理出來的文檔,也很不錯的,尤其前面兩個論壇你能學到很多東西的,不過還是推薦你先完整的看一本入門的後再說,不管理解了幾成,有什麼問題記下來,以後慢慢一點點解決。
ORACLE視頻教程的話有個中科院的什麼絕版培訓教程oracle 10g的04年的視頻,非常不錯,迅雷上搜索中科院oracle 10g培訓教程就能搜索到。
資料庫開發工具的話 有TOAD(客戶端連接工具),POWERDESIGN(資料庫設計建模工具,), PL/SQL DESIGNER(PL/SQL開發工具),一般這3個就夠用了,可以自己去迅雷搜索下載最新版本,另外的話還有一個叫DBATRIN,E/R 什麼的工具,很多的,其實裝了ORACLE客戶端工具後,自帶的JAVA控制台也很好用的。
當然你想一蹴而就的話,可以直接去網上找相關的ORACLE入門資料,那些都是些整理出來的條條,不過不推薦,最好多看書,多做實驗。
『玖』 目前哪些資料庫比較好各資料庫的簡單對比一下
沒啥好不好的,看需求啦,需要什麼就是什麼好,各個資料庫用途不太一樣。比如mysql 不要錢,而且用起來也比較簡單,三sqlserver 中小企業用著比較合適,oracle 大型企業會用,如果中小企業用它就會比較浪費,當然也不是光分企業,比如有些是數據型的公司,人家對數據要求高,也會選些嚴禁的資料庫。db2的話很多銀行都會用,安全性好。
『拾』 什麼資料庫比較好用
現在最好用的就是cache資料庫了,它有這些特點:
1、速度快。Caché資料庫在同等條件下查詢相同數據比Oracle等普通資料庫要快。原因是Caché資料庫又叫做後關系型資料庫(Post-Relation),顧名思義,Caché是基於普通關系型資料庫如:Oracle, SQL server, Sybase等的基礎之上並有所改進而產生的。
2、使用簡單。Caché資料庫支持標准SQL語句,因此不太熟悉M語言的用戶依然可以輕易對資料庫中的數據進行操作。
3、介面容易。Caché資料庫支持ODBC標准介面,因此在與其他系統進行數據交換時非常容易。同時Caché亦可以將數據輸出成文本文件格式以供其它系統訪問調用。
4、真正的3層結構。
5、對象型編輯。Caché資料庫是真正的對象型資料庫,開發時用戶可直接用資料庫定義自己想要的對象,然後再在其它開發工具中調用該對象的方法和屬性即可完成開發工作,非常方便;支持遠程映射和鏡像。
6、支持WEB開發。Caché資料庫提供自帶的Web開發工具,使用維護非常方便,符合當今軟體業發展的趨勢。
7、價格便宜。Caché資料庫的價格比Oracle要便宜許多。