㈠ 轉錄組原始數據包括什麼
轉錄組原始數據包括遞交原始序列。
轉錄組有兩部分數據要遞交,首先是拼接的轉錄組序列,一般遞交到tsa上,另一個是fastq的原始測序數據,一般遞交到sra上。前兩年還有論文只提交tsa不遞交原始數據,目前發表的論文基本都要提交。這也是便於其他人可以完全重復你的實驗和數據分析的必要要求。
簡介
GSA(Genome Sequence Archive)是一個存儲基因組、轉錄組以及其他Omics原始序列數據的資料庫。GSA允許用戶創建、上傳並存儲序列數據。GSA提供對項目信息(BioProject)、樣本信息(BioSample)、實驗信息(Experiment)以及測序數據的有效組織與管理。
㈡ 時間戳是什麼,通俗解釋
時間戳是指格林威治時間自1970年1月1日(00:00:00 GMT)至當前時間的總秒數。通俗的講,時間型宴猛戳是一份能夠表示一份數據在一個特定時間點已經存在的完整的可驗證的數據。
時間戳(time-stamp)是一個經加密後形成的憑證文檔,它包括三個部分:
1、需加時間戳的文件的摘要(digest);
2、DTS收到文件的日期和時間;
3、DTS的數字簽名。
一般來說,時間戳產生的過程為:用戶首先將需要加時間的文件用祥信Hash編碼加密形成摘要,然後將該摘要發送到DTS,DTS在加入了收到文件摘要的日期和時間信息後再對該文件加密(數字簽名),然後送回用戶。
書面簽署文件的時間是由簽署人知己寫上的,而數字時間戳則不然,它是有認證單位DTS來加的,以DTS收到文件的時間為依據。
(2)如何下載tsa資料庫序列擴展閱讀
《時間戳規范》的標准中規定了時間戳的保存、 時間戳的備份、 時間戳的檢索、 時間戳的刪除和銷毀、 時間戳的查看和驗卜橋證。
時間戳的保存包括在TSA (時間戳機構)方的保存和在用戶方的保存。 在TSA方的保存涉及到時間戳資料庫的管理和時間戳。
記錄應當包含的信息項, 一般最少應包括入庫時間、 序列號、 完整編碼等。 時間戳在用戶方一般由用戶自行保存。
時間戳的備份在標准中規定了一系列要求, 如定期備份、 備份介質等。
時間戳的檢索在標准中規定了至少三種檢索方式, 包括分別按照入庫時間、 序列號、 完整編碼檢索。
當TSA系統由於內部錯誤或者外部攻擊導致產生錯誤的時間戳時, 標准規定了刪除時應遵循的要求。 在確定某時間戳已經喪失其價值後, 標准規定了銷毀時應遵循的要求。