ncbi包括的資料庫有哪些

① 常用的醫學資料庫和網路醫學資源有哪些

有MEDLINE、《中華醫學雜志》、骨密度資料庫、CBM、PubMed等。

1、MEDLINE

MEDLINE是美國國立醫學圖書館(The National Library of Medicine, 簡稱NLM)生產的國際性綜合生物醫學信息書目資料庫，是當前國際上最權威的生物醫學文獻資料庫。

內容包括美國《醫學索引》（Index Medicus, IM）的全部內容和《牙科文獻索引》（Index to Dental Literature）、《國際護理索引》（International Nursing Index）的部分內容。

2、《中華醫學雜志》

《中華醫學雜志》是1915年創辦的雙語學術期刊，周刊，中國科學技術協會主管，中華醫學會主辦。

期刊主要反映中國醫學最新的科研成果，積極推廣醫葯衛生領域的新技術、新成果，及時交流防病治病的新經驗。

3、骨密度資料庫

2004 年11 月，GE 公司與中華醫學會合作, 完成中國大陸骨密度正常值資料庫項目，開創了中國骨密度發展的新時代，是中國醫學界將臨床問題數字化的一項巨大突破。

該項目的完成， 徹底結束了用其他人種的標准診斷中國人骨密度狀況的混亂局面，樹立了醫生和患者對骨密度測量和骨質疏鬆定量診斷的信任。

4、CBM

CBM由中國醫學科學院醫學信息研究所/圖書館開發研製的中國生物醫學文獻服務系統（SinoMed）；

整合了中國生物醫學文獻資料庫（CBM）、西文生物醫學文獻資料庫（WBM）、北京協和醫學院博碩學位論文庫等多種資源，是集檢索、免費獲取、個性化定題服務、全文傳遞服務於一體的生物醫學中外文整合文獻服務系統。

可訪問中國生物醫學文獻資料庫（CBM）資源 ，北京協和醫學院博碩學位論文庫（每篇論文的前30頁內容）。

CBM收錄1978以來1600餘種中國生物醫學期刊，以及匯編、會議論文的文獻題錄530餘萬篇，全部題錄均進行主題標引和分類標引等規范化加工處理。年增文獻40餘萬篇，每月更新。

5、PubMed

PubMed 資料庫是美國國立醫學圖書館(National libraryof Medicine， NLM) 的國家生物技術信息中心(National Center for Biotechnology Information，NCBI)研製開發的， 設在國家健康研究院。

PubMed 資料庫收錄MEDLINE， PRE-MEDLINE， 還有其它如《Science》， 《Nature》 等電子期刊構成的資料庫。 自1996年至今，該資料庫收錄約1000 萬篇生物醫學文獻。

可供檢索的專業為，分子生物學及NCBI 部分的資料庫題錄。它收錄了美國和另外70 個國家出版的生物醫學期刊約3900種。

PubMed 網上更新速度是每周1次。Medline 收錄的大多數論文原始語種是英語， 或有英文摘要。

參考資料來源：網路——醫學資料庫

② NCBI有多少資料庫，分別有什麼作用

在生物醫學信息學領域，資料庫和服務的定義與計算機領域有很大的不同，如果要問NCBI過去，現在或將來會有多少資料庫，恐怕連NCBI自己都說不清楚。要是一個一個資料庫講下來，9999個字肯定不夠用。這里有一個列表供您參考http://www.ncbi.nlm.nih.gov/guide/all/。

NCBI的產生和發展是在美國和全球生物學高速發展，高通量數據急速產生，而缺乏有效的數據分析方法的背景下產生，起初它主要任務是數據的存儲和查詢。只不過其存儲的數據大多以高通量數據為主，例如基因測序，基因組，SNP, 基因晶元,小分子化合物和GWAS數據等。這些數據的共享，極大地促進了生物信息學發展。

按照數據->樣式->知識->智慧的發展模式，NCBI主要起到了一個為生物學家提供數據的角色。不過，NCBI目前也不斷地在調整自己的角色。例如，生物醫學文獻。NCBI在從NLM繼承過來的pubmed的基礎，提供以PMC資料庫為核心的全文文獻服務。PubMed資料庫應該是全球生物學家使用頻率最高的資料庫。NCBI最近對pubmed的改版，雖然沒有實質性的改變，但其按照用戶體驗進行的修改，足見其對該資料庫的重視。

另外，NCBI目前不斷地在引入高學歷生物學人才對其資料庫的質量進行控制。以dbSNP為例，其正在通過與領域專家的合作將突變數據與人類表型數據進行關聯。

總得來講，NCBI的發展是與生物學高通量數據產生密切相關，它以經不在局限於提供數據存儲與查詢，其未來的發展必將發展為一個大型的、綜合的知識庫。到那時NCBI會不會免費，就要另當別論了。很顯然沒有人會將自己的手稿拱手讓人。如果真有那麼一天，不知道從中會產生多少專利和知識產權。

③ NCBI是什麼主要是做什麼

NCBI是National Center for Biotechnology Information的縮寫，指美國國家生物技術信息中心，建立於1988年。

NCBI的初衷是為了給分子生物學家提供一個信息儲存和處理的系統。除了建有GenBank核酸序列資料庫（該資料庫的數據資源來自全球幾大DNA資料庫，其中包括日本DNA資料庫DDBJ、歐洲分子生物學實驗室資料庫EMBL以及其它幾個知名科研機構）之外，NCBI還可以提供眾多功能強大的數據檢索與分析工具。

(3)ncbi包括的資料庫有哪些擴展閱讀：

NCBI提供的資源有Entrez、Entrez Programming Utilities、My NCBI、PubMed、PubMed Central、Entrez Gene、NCBI Taxonomy Browser、BLAST、BLAST Link (BLink)、Electronic PCR等共計36種功能，而且都可以在NCBI的主頁www.ncbi.nlm.nih.gov上找到相應鏈接，其中多半是由BLAST功能發展而來的。

已故參議員克勞德·佩珀認識到計算機化信息處理方法對於進行生物醫學研究的重要性以及贊助立法，該立法於1988年11月4日成立了國家生物技術信息中心（NCBI），作為國家醫學圖書館的一個部門（NLM） ）在美國國立衛生研究院（NIH）。

④ 高通量測序數據公共資料庫有哪些

我原來常用的：

NCBI：持有INSDC的節點。網站上有核酸、蛋白、基因名、基因組名等等的搜索工具，以及BLAST序列比對搜索工具，PUBMED文獻資料庫，Taxonomy數據，COG蛋白家族庫等等。FTP可以下到它全部的資料庫，BLAST的單機程序，以及各種工具程序。

EBI：和NCBI類似，歐洲搞的對等物。感覺EBI網站比NCBI要清楚簡潔。另外EBI網站整合了更多的工具，比如多序列比對。

Uniprot：全蛋白庫。NCBI和EBI的蛋白庫來源於此。目前包括兩部分：SwissProt是人工校對過的，TrEMBL是自動校對的。

Pfam：蛋白家族庫。可以使用配套的HMMER進行搜索。比BLAST能找到更遠緣的東西，而且找到的東西是結構域。
Rfam：RNA的，類似Pfam。