『壹』 請問怎麼查一個生物的基因組的全序列
假如你要查蛋白質
例:1.網址中輸入NCBI,點開NCBI主頁。
2.在主頁的右上方有可選框,選擇protein,後面輸入蛋白名稱,如果想具體找到的話,直接輸入物種加蛋白,回車即可。
『貳』 怎樣在NCBI中查找一物種的全基因組
直接用關鍵詞Homosapiensmitochondrion在genome資料庫中搜索就行了。找completegenome
『叄』 如何查基因組
很多物種都有其單獨的基因組資料庫網站,如斑馬魚。你可以google下,如zebrafish genome database,可以找到ZFIN
還有,一般NCBI裡面會收錄已經測序的基因組
『肆』 怎麼查找一個蛋白質的基因組序列
網址中輸入NCBI,點開NCBI主頁。。在主頁的右上方有可選框,選擇protein,後面輸入蛋白名稱,如果想具體找到的話,直接輸入物種加蛋白,回車即可。
1、打開NCBI主頁。
2、左邊search裡面選擇GENE 右邊的對話框里輸入你想要的基因名稱。
3、 在出來的所有條目第一行後面都有種屬表明,比如Homo sapiens是人Felis catus是貓。選擇你想要的種屬。
4、再出現的頁面中找到那個像數軸的圖,在左側有可以點擊的藍色數字,往往開頭有AK、NM的開頭,點擊它,再出現的下拉框里選擇GENEBANK。
5、最下面就是他的基因序列 當然也可以參考頁面上提供的CDS區域范圍來看。
注意事項
NCBI (National Center for Biotechnology Information)是指美國國立生物技術信息中心。理解自然無聲但精妙的關於生命細胞的語言是現代分子生物學的要求。通過只有四個字母來代表DNA化學亞基的字母表,出現了生命過程的語法,其最復雜形式就是人類。
闡明和使用這些字母來組成新的「單詞和短語」是分子生物學領域的中心焦點。數目巨大的分子數據和這些數據的隱秘而精細的模式使得計算機化的資料庫和分析方法成為絕對的必須。
『伍』 求助,如何查找細菌的全基因組序列
可以在NCBI,genome資料庫。
從genome資料庫里找的話就比較麻煩,想用RACE,3'末端需要添加像真核物polyA尾巴,且要克隆全基序列,要做5'RACE.
RACE技術比較適合真核物.
要克隆基保守,genbank查找些與菌親緣關系比較近菌種,看基已經提交,全基組更,通設計同源引物,便基克隆.原核物基含內含,所基組擴增,原核物mRNA穩定.
7氨基酸序列用NCBI比找同源序列比較困難.縮范圍做比,比Burkholderia基或蛋白做比(參數選擇Choose Search SetOrganism限定物種).另外,用blastp找同源序列,妨用tblastnBurkholderia基組或者所細菌核酸序列比看看
.NCBI種Burkholderiagenome序列.外,關於Burkholderia脂肪酶基序列,設定關鍵詞查,蛋白序列都載做序列比較,至少同源性,及氨基酸序列跟同源性定啟示.
『陸』 如何通過生物信息資料庫分析某一物種的基因和蛋白質信息,包括基因組DNA;基因結構;mRNA;蛋白質的1-4級
問題不是很明確,是想進行序列比對與結構比對嗎?序列比對用NCBI網站中的Blast就可以分別進行核酸與蛋白的比對,蛋白結構比對,如果沒有晶體結構,就需要先同源建模,再進行結構擬合就可以了!希望能幫到你,有問題歡迎追問!
『柒』 怎樣在NCBI中查找一物種的全基因組
打開後在Search中選擇Nucleotide再在下面輸入FRAT1點擊Search即可也可輸入具體的物種名以縮小范圍.
『捌』 如何用NCBI資料庫查病毒全基因的背景信息
選擇NCBI genome資料庫,這個庫中收錄目前經過測序的所有物種的參考基因組。你只要輸入你需要的病毒名稱比如HIV,就可以看到這個病毒的全基因組序列。你還可以點擊某條序列,進入到詳細信息界面,就可以看到這個序列的來源。
『玖』 如何從基因組數據中查找基因家族
NCBI中的gene資料庫,然後把你的基因名稱輸入,並選擇相應的種屬,點擊相應的基因後,你就會看到這個基因的所有isoform。如果不清楚的話,可以直接聯系我
fanby (站內聯系TA)
2樓: Originally posted by xxj0214246 at 2013-02-11 13:21:08
NCBI中的gene資料庫,然後把你的基因名稱輸入,並選擇相應的種屬,點擊相應的基因後,你就會看到這個基因的所有isoform。如果不清楚的話,可以直接聯系我
該基因在研究的物種中的cDNA序列未知。我想咨詢的問題是,基於已經分離該基因的一個cDNA序列,通過何種實驗方法可以分離到其他成員的序列?謝謝!